More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A1078 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1175  branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  99.82 
 
 
570 aa  1115    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.139317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1078  branched chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  100 
 
 
570 aa  1118    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0441127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7509  branched chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  52.35 
 
 
580 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2539  ABC transporter-like protein  47.58 
 
 
559 aa  454  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.119506  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5562  ABC transporter related  34.7 
 
 
891 aa  230  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489183  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  37.01 
 
 
924 aa  212  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  31.82 
 
 
599 aa  211  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  30.88 
 
 
593 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  30.07 
 
 
598 aa  203  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  31.73 
 
 
593 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  31.65 
 
 
593 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  32.88 
 
 
830 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  30.93 
 
 
660 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  32.62 
 
 
611 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  28.95 
 
 
950 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  29.32 
 
 
648 aa  193  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  29.81 
 
 
593 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2952  ABC transporter related  30.8 
 
 
930 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  29 
 
 
624 aa  191  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  29.98 
 
 
589 aa  190  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  32.37 
 
 
608 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  33.27 
 
 
827 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  29.31 
 
 
589 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  32.38 
 
 
823 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  29.04 
 
 
590 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  30.89 
 
 
610 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  28.42 
 
 
594 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  29.92 
 
 
589 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  32.51 
 
 
823 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  27.54 
 
 
594 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  29.81 
 
 
840 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  28.62 
 
 
583 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  30.8 
 
 
832 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  27.1 
 
 
594 aa  180  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  30.77 
 
 
611 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  29.7 
 
 
838 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  27.1 
 
 
594 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  30.86 
 
 
606 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  28.38 
 
 
603 aa  178  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  29.62 
 
 
594 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  27.45 
 
 
594 aa  177  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.62 
 
 
594 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.62 
 
 
594 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  27.67 
 
 
594 aa  176  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  28.77 
 
 
594 aa  176  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3152  ABC transporter related  30.73 
 
 
943 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  29.44 
 
 
594 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.44 
 
 
594 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.44 
 
 
594 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  26.62 
 
 
594 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  27.9 
 
 
588 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.44 
 
 
594 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  26.62 
 
 
594 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  31.24 
 
 
954 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  26.62 
 
 
594 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  31.09 
 
 
908 aa  175  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  28.5 
 
 
589 aa  174  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  31.61 
 
 
822 aa  174  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  30.16 
 
 
616 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  28.82 
 
 
590 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  27.85 
 
 
594 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5601  ABC transporter related protein  29.98 
 
 
563 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  30.02 
 
 
582 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  28.6 
 
 
590 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  28.71 
 
 
951 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  29.6 
 
 
608 aa  169  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  30.95 
 
 
852 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  29.03 
 
 
599 aa  169  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  27.09 
 
 
617 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  28.94 
 
 
621 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3190  ABC transporter related  31.36 
 
 
956 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1684  ABC transporter related  28.34 
 
 
629 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0459583  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  29.31 
 
 
604 aa  161  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  28.07 
 
 
613 aa  161  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  39.36 
 
 
252 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  27.39 
 
 
608 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  27.39 
 
 
608 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  29.22 
 
 
842 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  28.34 
 
 
631 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  27.9 
 
 
597 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  26.82 
 
 
608 aa  157  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  31.15 
 
 
828 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  35.77 
 
 
989 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3248  ABC transporter related  29.42 
 
 
959 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  27.38 
 
 
630 aa  154  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  38.43 
 
 
245 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  28.57 
 
 
589 aa  153  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1206  ABC transporter-related protein  38.36 
 
 
239 aa  151  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2715  ABC transporter related  39.66 
 
 
239 aa  151  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00707444  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3488  ABC transporter related protein  40 
 
 
244 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4485  ABC transporter related  38.58 
 
 
250 aa  151  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4110  ABC transporter related  38.72 
 
 
239 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  38.96 
 
 
257 aa  150  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0266  ABC transport system ATP-binding protein  38.59 
 
 
240 aa  150  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0053  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 
240 aa  150  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  28.24 
 
 
625 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  33.82 
 
 
296 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0046  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
240 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0054  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 
240 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  36.47 
 
 
255 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>