More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2715 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2715  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00707444  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1206  ABC transporter-related protein  84.1 
 
 		 239 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4110  ABC transporter related  74.06 
 
 		 239 aa  346  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  41.9 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  41.5 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  41.39 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  43.95 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  38.98 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 		 248 aa  179  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  39.76 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  38.4 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  38 
 
 		 274 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  37.3 
 
 		 282 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  37.3 
 
 		 296 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.37 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 250 aa  175  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  36.9 
 
 		 275 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  41.04 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  36.8 
 
 		 280 aa  174  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  37.6 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  36.22 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3868  ABC transporter related  43.04 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  40.56 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  43.22 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  42.57 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  39.76 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  37.35 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  37.89 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  34.52 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  41.2 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  40.08 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  36 
 
 		 266 aa  171  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  40.98 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  41.18 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  36.4 
 
 		 259 aa  171  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  40.96 
 
 		 250 aa  171  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5344  ABC transporter related  40.66 
 
 		 244 aa  171  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  40.55 
 
 		 294 aa  171  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  34.65 
 
 		 265 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2792  ABC transporter related protein  45.53 
 
 		 248 aa  170  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0677  ABC transporter related  40.8 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  37.2 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  34.8 
 
 		 256 aa  170  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  41.53 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  38.71 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  37.2 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  40.62 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  37.15 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4016  ABC transporter related  43.93 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  39.51 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  39.75 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0555  ABC transporter-like  36.27 
 
 		 290 aa  168  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0226629  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  34.65 
 
 		 269 aa  168  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  38.8 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  36.4 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.58 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  36.8 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  39.76 
 
 		 250 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  39.18 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  38.34 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  38.34 
 
 		 289 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  39.09 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1563  ABC transporter related protein  37.34 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  39.68 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  37.15 
 
 		 256 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  37.3 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.86 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37.6 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  40 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  36 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  33.73 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1584  ABC transporter related  39.6 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  36.86 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  37.9 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  38.68 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  35.6 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  37.9 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  39.02 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  39.02 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 		 256 aa  165  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  34.8 
 
 		 252 aa  165  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  43.83 
 
 		 924 aa  165  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.69 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  39.3 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  41.53 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  38.49 
 
 		 252 aa  165  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  36.4 
 
 		 264 aa  165  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  39.75 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  35.57 
 
 		 259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  38.49 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  44.3 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0231  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 255 aa  164  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  36.76 
 
 		 256 aa  164  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  40.16 
 
 		 253 aa  164  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>