More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0053 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2668  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  99.17 
 
 		 240 aa  463  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0266  ABC transport system ATP-binding protein  100 
 
 		 240 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0054  ABC transporter, ATP-binding protein  99.58 
 
 		 240 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2711  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  99.17 
 
 		 240 aa  463  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1841  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  99.17 
 
 		 240 aa  463  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3286  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  99.17 
 
 		 240 aa  463  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0053  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 240 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0046  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  97.92 
 
 		 240 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4452  ABC transporter related  57.51 
 
 		 234 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.130347 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2539  ABC transporter-like protein  40.6 
 
 		 559 aa  164  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.119506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1981  ABC transporter related protein  41.04 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4485  ABC transporter related  41.53 
 
 		 250 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6100  ABC transporter related  41.42 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  38.31 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4016  ABC transporter related  41.32 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  35.2 
 
 		 250 aa  158  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  38.98 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  36.08 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  34.9 
 
 		 263 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  38 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2737  ABC transporter related  33.86 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  38 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1783  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  38.58 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0473168  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.65 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  36.14 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  36.25 
 
 		 262 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  38.96 
 
 		 252 aa  154  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.11 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  37.94 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.11 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  36.8 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  38.52 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  38.15 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3868  ABC transporter related  40.43 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.85 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.86 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  34.8 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  34.66 
 
 		 250 aa  151  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  42.08 
 
 		 611 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  37.8 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  35.74 
 
 		 286 aa  151  8.999999999999999e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3488  ABC transporter related protein  38.08 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4380  ABC transporter related protein  43.97 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.794104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  36.25 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0382  ABC transporter related  43.97 
 
 		 538 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  36.25 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  34.66 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1175  branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.59 
 
 		 570 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.139317  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  39.6 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  41.25 
 
 		 608 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  38.68 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1078  branched chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.59 
 
 		 570 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0441127  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  37.6 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  35.6 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.46 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  37.2 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  35.34 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  37.4 
 
 		 610 aa  148  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  34.54 
 
 		 251 aa  148  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.54 
 
 		 256 aa  148  6e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.46 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.41 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.46 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  42.26 
 
 		 823 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  38.91 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  36.8 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  40.73 
 
 		 593 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  37.01 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0775  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2141  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558111  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  34.12 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  38.59 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  36.11 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  37.96 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  35.6 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.86 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  36.72 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  34.77 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  40.32 
 
 		 593 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  37.39 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  37.01 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5244  ABC transporter ATP-binding protein  40.42 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.104577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  37.71 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  37.01 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  37.96 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0865  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  34.92 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  37.4 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  37.01 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 611 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2637  ABC transporter related protein  42.42 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  33.2 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19620  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.11 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00232655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  37.15 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  41.84 
 
 		 823 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  37.55 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3351  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.06 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>