More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2136 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2952  ABC transporter related  54.5 
 
 
930 aa  771    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  46.87 
 
 
956 aa  685    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  100 
 
 
908 aa  1757    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  29.41 
 
 
989 aa  290  8e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5562  ABC transporter related  31.08 
 
 
891 aa  286  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489183  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  31.67 
 
 
924 aa  278  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3248  ABC transporter related  29.88 
 
 
959 aa  257  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  32.17 
 
 
940 aa  250  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  33.68 
 
 
599 aa  246  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  34.54 
 
 
614 aa  243  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  28.91 
 
 
950 aa  239  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  28.39 
 
 
951 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  31.71 
 
 
593 aa  225  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  29.94 
 
 
643 aa  220  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  29.65 
 
 
663 aa  219  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.28 
 
 
594 aa  219  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  31.51 
 
 
593 aa  218  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  30 
 
 
648 aa  218  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  32.23 
 
 
594 aa  218  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.23 
 
 
594 aa  218  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.06 
 
 
594 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  32.23 
 
 
594 aa  217  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.23 
 
 
594 aa  217  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.23 
 
 
594 aa  217  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.23 
 
 
594 aa  217  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  32.12 
 
 
594 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  31.53 
 
 
594 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  31.95 
 
 
594 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  31.95 
 
 
594 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  31.53 
 
 
594 aa  213  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  31.79 
 
 
594 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  31.95 
 
 
594 aa  212  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  31.8 
 
 
589 aa  211  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
704 aa  210  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  29.34 
 
 
598 aa  209  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  29.54 
 
 
590 aa  208  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  30.89 
 
 
594 aa  208  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.56 
 
 
594 aa  208  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  33.04 
 
 
608 aa  208  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3190  ABC transporter related  34.66 
 
 
956 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3489  inner-membrane translocator  34.03 
 
 
743 aa  206  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  31.37 
 
 
594 aa  205  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  35.93 
 
 
697 aa  205  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  35.29 
 
 
822 aa  204  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  30.13 
 
 
588 aa  203  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  29.95 
 
 
589 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4016  ABC transporter related  47.24 
 
 
272 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  30.04 
 
 
582 aa  202  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  33.39 
 
 
593 aa  201  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  29.93 
 
 
599 aa  200  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7509  branched chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.22 
 
 
580 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  32.81 
 
 
611 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  31.5 
 
 
589 aa  199  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.02 
 
 
596 aa  198  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  33.74 
 
 
823 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  33.05 
 
 
593 aa  197  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  29.73 
 
 
608 aa  197  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  29.73 
 
 
608 aa  197  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1078  branched chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.46 
 
 
570 aa  196  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0441127  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  31.99 
 
 
611 aa  196  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  29.45 
 
 
617 aa  196  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  32.62 
 
 
606 aa  196  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  31.59 
 
 
630 aa  195  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  29.9 
 
 
565 aa  195  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  32.57 
 
 
612 aa  195  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1175  branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.46 
 
 
570 aa  194  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.139317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8309  inner-membrane translocator  34.41 
 
 
652 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3868  ABC transporter related  44.98 
 
 
237 aa  191  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  32.19 
 
 
595 aa  190  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  33.33 
 
 
823 aa  190  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  29.35 
 
 
597 aa  190  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  31.02 
 
 
624 aa  190  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  29.9 
 
 
597 aa  190  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  32.54 
 
 
682 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  28.67 
 
 
589 aa  188  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3488  ABC transporter related protein  43.9 
 
 
244 aa  188  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  32.73 
 
 
625 aa  189  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  31.83 
 
 
604 aa  188  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  33.51 
 
 
608 aa  188  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  30.54 
 
 
589 aa  187  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  31.5 
 
 
631 aa  187  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  30.98 
 
 
830 aa  187  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  34.3 
 
 
827 aa  187  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2539  ABC transporter-like protein  30.85 
 
 
559 aa  184  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.119506  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3152  ABC transporter related  43.68 
 
 
943 aa  184  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  29.89 
 
 
610 aa  184  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3223  ABC transporter related  45.59 
 
 
573 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  30.95 
 
 
660 aa  181  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  31.23 
 
 
583 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  30.16 
 
 
590 aa  179  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  30.66 
 
 
590 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2268  ABC transporter related  44.94 
 
 
262 aa  177  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8310  ABC transporter related  44.35 
 
 
277 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.575602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  32.64 
 
 
828 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  32.55 
 
 
832 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  40.32 
 
 
254 aa  175  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  38.91 
 
 
280 aa  174  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  30.74 
 
 
590 aa  174  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2792  ABC transporter related protein  45.97 
 
 
248 aa  174  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.44 
 
 
251 aa  174  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>