More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8309 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8309  inner-membrane translocator  100 
 
 		 652 aa  1261    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  47.45 
 
 		 697 aa  462  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3489  inner-membrane translocator  39.01 
 
 		 743 aa  325  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 704 aa  324  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  35.4 
 
 		 898 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2952  ABC transporter related  33.28 
 
 		 930 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 908 aa  181  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4038  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 816 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  30.91 
 
 		 956 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5664  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 741 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269421  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  31.21 
 
 		 940 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3222  inner-membrane translocator  30.59 
 
 		 684 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8833  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 637 aa  144  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.756263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4486  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 661 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  29.07 
 
 		 989 aa  140  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  30.72 
 
 		 924 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0381  inner-membrane translocator  33.28 
 
 		 692 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1283  ABC transporter related  30.81 
 
 		 1087 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.887426  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5562  ABC transporter related  31.72 
 
 		 891 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3350  inner-membrane translocator  29.54 
 
 		 659 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3084  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 623 aa  114  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00985997  normal  0.0142053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  27.99 
 
 		 950 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  27.2 
 
 		 628 aa  112  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 321 aa  112  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  33.71 
 
 		 606 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 358 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  33.2 
 
 		 358 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 358 aa  108  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0096  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.26 
 
 		 607 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  28.01 
 
 		 628 aa  107  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  28.45 
 
 		 637 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  26.47 
 
 		 642 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  28.67 
 
 		 308 aa  105  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  29.34 
 
 		 1302 aa  104  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 407 aa  105  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.78 
 
 		 325 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0855  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 772 aa  102  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.852549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  29.24 
 
 		 311 aa  101  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3190  ABC transporter related  28.85 
 
 		 956 aa  101  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  26.74 
 
 		 292 aa  101  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  28.7 
 
 		 630 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 317 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.13 
 
 		 603 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  24.75 
 
 		 656 aa  100  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  32.6 
 
 		 593 aa  100  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1616  inner-membrane translocator  28.91 
 
 		 622 aa  100  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0311969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 300 aa  100  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 290 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  28.8 
 
 		 378 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 348 aa  100  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  36.53 
 
 		 349 aa  100  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 381 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  26.47 
 
 		 603 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  32.03 
 
 		 415 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 373 aa  99.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.86 
 
 		 328 aa  99.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1545  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 358 aa  99.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.137578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  32.27 
 
 		 593 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 293 aa  98.2  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  32.77 
 
 		 648 aa  97.8  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 324 aa  97.8  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 345 aa  97.4  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  35.32 
 
 		 608 aa  97.4  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1156  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 354 aa  97.4  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.412429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  33.48 
 
 		 328 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  32.99 
 
 		 594 aa  95.5  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  26.13 
 
 		 603 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.96 
 
 		 332 aa  94.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 346 aa  94.4  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.49 
 
 		 594 aa  94  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.94 
 
 		 594 aa  94.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  27.48 
 
 		 309 aa  94  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  26.62 
 
 		 603 aa  94  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  32.91 
 
 		 594 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  32.49 
 
 		 594 aa  93.2  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3010  inner-membrane translocator  27.17 
 
 		 291 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000508141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  26.29 
 
 		 951 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2276  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.47 
 
 		 358 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.158559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  30.42 
 
 		 594 aa  92.8  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0951  inner-membrane translocator  33.47 
 
 		 358 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  28.01 
 
 		 358 aa  92.8  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0379  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livM  33.2 
 
 		 358 aa  92.8  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3248  ABC transporter related  28.5 
 
 		 959 aa  92.8  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  32.49 
 
 		 594 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  32.49 
 
 		 594 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  33.62 
 
 		 643 aa  92  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 345 aa  92  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  29.41 
 
 		 334 aa  92  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 337 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.07 
 
 		 594 aa  92  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 327 aa  92  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5717  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  30.1 
 
 		 357 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  28.37 
 
 		 290 aa  92  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  32.49 
 
 		 594 aa  92  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1781  ABC transporter permease  32.95 
 
 		 287 aa  91.7  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0603975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  32.07 
 
 		 594 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  32.07 
 
 		 594 aa  91.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.07 
 
 		 594 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>