More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1980 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  100 
 
 		 898 aa  1712    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  48.73 
 
 		 940 aa  680    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  29.95 
 
 		 956 aa  268  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 697 aa  239  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3489  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 743 aa  231  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3222  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 684 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4038  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 816 aa  228  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 704 aa  209  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  30.2 
 
 		 924 aa  208  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2952  ABC transporter related  29.72 
 
 		 930 aa  203  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  44.16 
 
 		 245 aa  195  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  41.56 
 
 		 234 aa  191  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  41.6 
 
 		 239 aa  187  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8309  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 652 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  44.13 
 
 		 247 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2137  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 251 aa  185  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0427504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  41.99 
 
 		 256 aa  184  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  43.72 
 
 		 247 aa  184  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  43.72 
 
 		 247 aa  184  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  42.15 
 
 		 253 aa  184  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  28.53 
 
 		 908 aa  183  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  42.46 
 
 		 247 aa  181  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1841  ABC transporter related  44.3 
 
 		 263 aa  178  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0865  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.11 
 
 		 240 aa  178  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0314123  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3487  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 247 aa  177  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4486  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 661 aa  177  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  26.44 
 
 		 950 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  40.93 
 
 		 238 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  42.67 
 
 		 238 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  26.41 
 
 		 989 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 235 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3248  ABC transporter related  28.03 
 
 		 959 aa  175  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 243 aa  175  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  41.1 
 
 		 239 aa  174  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  41.63 
 
 		 233 aa  174  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5664  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 741 aa  174  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269421  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 		 233 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5600  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 235 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  46.32 
 
 		 242 aa  172  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0855  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 772 aa  172  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.852549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  27.9 
 
 		 590 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  29.74 
 
 		 589 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 		 233 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  44.57 
 
 		 822 aa  172  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3396  ABC transporter related  43.67 
 
 		 229 aa  171  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  40.76 
 
 		 437 aa  171  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2539  ABC transporter-like protein  29.26 
 
 		 559 aa  171  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.119506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 		 237 aa  171  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  41.38 
 
 		 233 aa  171  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  43.95 
 
 		 246 aa  171  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  40.31 
 
 		 258 aa  171  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  43.49 
 
 		 823 aa  171  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3869  ABC transporter related  47.41 
 
 		 235 aa  170  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166635  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 237 aa  170  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1078  branched chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.22 
 
 		 570 aa  170  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0441127  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 		 237 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  43.06 
 
 		 823 aa  169  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  45.96 
 
 		 238 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 		 237 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 		 237 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  41.45 
 
 		 235 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  45.96 
 
 		 238 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  39.48 
 
 		 238 aa  169  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 		 237 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 		 237 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 		 233 aa  169  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2475  ABC transporter related  43.5 
 
 		 248 aa  168  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  41.7 
 
 		 239 aa  168  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  41.88 
 
 		 248 aa  168  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2953  ABC transporter related  45.81 
 
 		 249 aa  168  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.181983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  40.43 
 
 		 236 aa  168  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0288  ABC transporter related  45.62 
 
 		 241 aa  168  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.53 
 
 		 238 aa  167  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  27.5 
 
 		 589 aa  167  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  42.55 
 
 		 827 aa  167  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  41.46 
 
 		 237 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  41.46 
 
 		 237 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  41.46 
 
 		 237 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1175  branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.07 
 
 		 570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.139317  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.46 
 
 		 237 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  42.06 
 
 		 234 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  43.05 
 
 		 244 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  28.5 
 
 		 589 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.46 
 
 		 237 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.46 
 
 		 237 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  42.49 
 
 		 234 aa  167  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  38.87 
 
 		 251 aa  167  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  43.83 
 
 		 239 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  42.68 
 
 		 260 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  39.66 
 
 		 233 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3512  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.03 
 
 		 243 aa  166  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  40.85 
 
 		 241 aa  166  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  40.85 
 
 		 239 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  43.97 
 
 		 237 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.29 
 
 		 233 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.29 
 
 		 233 aa  165  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  40.52 
 
 		 233 aa  166  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  40.09 
 
 		 235 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.58 
 
 		 241 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  43.1 
 
 		 237 aa  165  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>