More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5664 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0855  inner-membrane translocator  81.16 
 
 		 772 aa  1023    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.852549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5664  inner-membrane translocator  100 
 
 		 741 aa  1409    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269421  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3350  inner-membrane translocator  49.43 
 
 		 659 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8833  inner-membrane translocator  48.24 
 
 		 637 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.756263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  31.28 
 
 		 697 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4038  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 816 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 704 aa  178  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  30.83 
 
 		 898 aa  171  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  30.43 
 
 		 940 aa  153  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1283  ABC transporter related  32.1 
 
 		 1087 aa  151  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.887426  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4486  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 661 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2952  ABC transporter related  31.18 
 
 		 930 aa  145  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  30.11 
 
 		 924 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  29.34 
 
 		 989 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0381  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 692 aa  134  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  29.9 
 
 		 908 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3489  inner-membrane translocator  27.47 
 
 		 743 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8309  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 652 aa  127  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  29.89 
 
 		 956 aa  125  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  31.36 
 
 		 1302 aa  121  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 349 aa  118  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3222  inner-membrane translocator  27.59 
 
 		 684 aa  117  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2539  ABC transporter-like protein  35.71 
 
 		 559 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.119506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3288  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 		 292 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2666  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34.36 
 
 		 292 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2713  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 		 292 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1839  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 		 292 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0055  ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 		 292 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0056  ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 		 292 aa  108  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 348 aa  105  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  26.37 
 
 		 292 aa  104  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4712  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 348 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3152  ABC transporter related  27.84 
 
 		 943 aa  102  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000401  branched-chain amino acid transport system permease protein livM  33.2 
 
 		 355 aa  100  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241122  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  27.17 
 
 		 950 aa  100  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5717  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  31.37 
 
 		 357 aa  99.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  31.88 
 
 		 648 aa  99.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3248  ABC transporter related  26.91 
 
 		 959 aa  99.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  29.16 
 
 		 642 aa  97.8  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1834  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 357 aa  97.4  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1004  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 333 aa  96.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  29.2 
 
 		 350 aa  95.9  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 358 aa  96.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0299  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 357 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658484  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  29.96 
 
 		 350 aa  96.7  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.83 
 
 		 603 aa  95.9  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3414  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.73 
 
 		 357 aa  95.5  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 297 aa  95.5  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  28.76 
 
 		 350 aa  95.1  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 352 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1078  branched chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.77 
 
 		 570 aa  95.1  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0441127  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1175  branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.77 
 
 		 570 aa  94.7  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.139317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 345 aa  94.7  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.95 
 
 		 656 aa  94.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1863  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 356 aa  94.7  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  33.04 
 
 		 345 aa  94  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0252  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 358 aa  93.6  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.231195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 352 aa  94  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1545  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 358 aa  93.2  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.137578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 352 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 355 aa  92.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 304 aa  93.2  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2608  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 357 aa  92.8  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2722  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 358 aa  92  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  0.425385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2306  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 357 aa  92  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  29.09 
 
 		 628 aa  92  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.03 
 
 		 646 aa  92  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3134  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 357 aa  91.7  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.628981  normal  0.885727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0379  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livM  35.27 
 
 		 358 aa  91.3  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.04 
 
 		 328 aa  90.9  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  27.49 
 
 		 603 aa  90.9  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  32.49 
 
 		 663 aa  90.5  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  30.6 
 
 		 646 aa  90.5  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 321 aa  90.1  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  33.2 
 
 		 293 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  27.49 
 
 		 603 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  26.99 
 
 		 603 aa  90.5  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 292 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0051  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 368 aa  89.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 319 aa  89.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 346 aa  89.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  31.83 
 
 		 606 aa  89  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  32.64 
 
 		 643 aa  88.2  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.8 
 
 		 325 aa  88.2  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  27.03 
 
 		 603 aa  87.8  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0268  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.33 
 
 		 264 aa  87.4  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4178  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 357 aa  87.4  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 316 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  27.36 
 
 		 290 aa  86.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  30.32 
 
 		 327 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 646 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 337 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  32.02 
 
 		 349 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1972  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 462 aa  86.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  30.53 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3003  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0263  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  32.19 
 
 		 593 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4296  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.77 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  decreased coverage  0.00201809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>