More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0381 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0381  inner-membrane translocator  100 
 
 		 692 aa  1311    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4486  inner-membrane translocator  44.08 
 
 		 661 aa  445  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  44.91 
 
 		 924 aa  395  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  42.38 
 
 		 989 aa  360  5e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5562  ABC transporter related  35.01 
 
 		 891 aa  239  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1283  ABC transporter related  33.44 
 
 		 1087 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.887426  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  33.23 
 
 		 1302 aa  161  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  30.71 
 
 		 940 aa  160  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4038  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 816 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0855  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 772 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.852549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  34 
 
 		 697 aa  154  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  29.87 
 
 		 898 aa  150  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 704 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5664  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 741 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269421  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3489  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 743 aa  142  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8309  inner-membrane translocator  33.39 
 
 		 652 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3350  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 659 aa  130  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  31.83 
 
 		 908 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3222  inner-membrane translocator  30.13 
 
 		 684 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8833  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 637 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.756263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  27.13 
 
 		 956 aa  114  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  31.91 
 
 		 350 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 350 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.91 
 
 		 350 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  30.39 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  25.22 
 
 		 950 aa  110  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 292 aa  110  8.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 349 aa  109  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.45 
 
 		 325 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 291 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 381 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2112  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 376 aa  104  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3152  ABC transporter related  28.71 
 
 		 943 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  27.18 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  32.67 
 
 		 646 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  25.78 
 
 		 628 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.83 
 
 		 423 aa  101  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2952  ABC transporter related  31.11 
 
 		 930 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  28.83 
 
 		 311 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 316 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.07 
 
 		 646 aa  100  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  29.66 
 
 		 373 aa  100  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  28.06 
 
 		 316 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  29.96 
 
 		 316 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 346 aa  99  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  27.7 
 
 		 316 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.7 
 
 		 316 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1863  inner-membrane translocator  29.27 
 
 		 356 aa  99.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  32.07 
 
 		 345 aa  99  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.62 
 
 		 328 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 317 aa  99.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  27.7 
 
 		 316 aa  99.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  27.7 
 
 		 316 aa  99.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 470 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.05 
 
 		 389 aa  98.6  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 393 aa  98.2  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 358 aa  98.2  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3324  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 484 aa  97.8  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0986477  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23000  branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  32.46 
 
 		 292 aa  97.8  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.135077  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  27.34 
 
 		 316 aa  97.8  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 384 aa  97.8  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  27.34 
 
 		 316 aa  97.8  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  27.34 
 
 		 316 aa  97.8  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  30.43 
 
 		 378 aa  97.8  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.44 
 
 		 424 aa  97.4  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  31.58 
 
 		 648 aa  97.8  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  27.5 
 
 		 290 aa  97.8  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3248  ABC transporter related  27.68 
 
 		 959 aa  97.4  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 		 298 aa  96.7  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.34 
 
 		 316 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  27.34 
 
 		 316 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 375 aa  97.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 345 aa  96.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 375 aa  97.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.34 
 
 		 316 aa  96.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 		 316 aa  96.3  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.34 
 
 		 316 aa  96.3  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 294 aa  96.3  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 		 298 aa  96.3  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 294 aa  95.9  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0477  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 346 aa  95.5  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 562 aa  95.1  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  30 
 
 		 324 aa  95.1  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1781  ABC transporter permease  31.25 
 
 		 287 aa  94.7  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0603975  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0299  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 357 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658484  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  24.63 
 
 		 656 aa  94.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  26.12 
 
 		 360 aa  94.4  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 353 aa  94.4  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 348 aa  94.4  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 292 aa  94.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.19 
 
 		 603 aa  94.4  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.24 
 
 		 316 aa  94.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 407 aa  94.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  37.68 
 
 		 599 aa  94  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  28.37 
 
 		 603 aa  94  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4006  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 328 aa  93.6  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 443 aa  93.2  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  28.23 
 
 		 603 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.58 
 
 		 290 aa  92.8  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>