More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1781 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1781  ABC transporter permease  100 
 
 		 287 aa  550  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0603975  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4592  inner-membrane translocator  67.94 
 
 		 283 aa  317  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23000  branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  52.05 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.135077  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 290 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  39.31 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  36.7 
 
 		 292 aa  181  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4242  inner-membrane translocator  39.59 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  37.89 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0350  inner-membrane translocator  40.78 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.018915  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1742  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0350501  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.76 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3010  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000508141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3557  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0430  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0151823  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 294 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 294 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  29.49 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0505  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 293 aa  129  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0978839  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  27.12 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  27.46 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3583  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0544  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.53 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1797  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160989 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  25.68 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  27.03 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  25.76 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1163  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  27.97 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  30.93 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  27.03 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  28.47 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4095  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3459  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.411869  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0298  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.474045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  28.81 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  31.02 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.48 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  28.27 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 289 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0402  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 296 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4108  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  28.28 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.03 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3164  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109839  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  27.8 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  30 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  29.7 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  28.33 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2425  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2307  inner-membrane translocator  26.92 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  28.18 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5147  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  31.74 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2180  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  30.07 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  30.14 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.87 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4063  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.18 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>