More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4038 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4038  inner-membrane translocator  100 
 
 		 816 aa  1573    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  34.34 
 
 		 940 aa  265  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  31.98 
 
 		 898 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3222  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 684 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3489  inner-membrane translocator  31.3 
 
 		 743 aa  207  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5664  inner-membrane translocator  29.8 
 
 		 741 aa  187  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269421  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0855  inner-membrane translocator  28.66 
 
 		 772 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.852549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2952  ABC transporter related  32.11 
 
 		 930 aa  175  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 704 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  30.12 
 
 		 956 aa  160  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4486  inner-membrane translocator  29.74 
 
 		 661 aa  156  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  31.16 
 
 		 924 aa  150  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1283  ABC transporter related  31.79 
 
 		 1087 aa  148  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.887426  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8309  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 652 aa  148  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  30.03 
 
 		 908 aa  145  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8833  inner-membrane translocator  31.87 
 
 		 637 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.756263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  31.5 
 
 		 1302 aa  139  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  28.28 
 
 		 697 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0381  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 692 aa  132  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  29.29 
 
 		 989 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2113  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 302 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3350  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 659 aa  118  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 293 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  28.03 
 
 		 603 aa  112  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.31 
 
 		 603 aa  111  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  31.88 
 
 		 593 aa  105  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  25.42 
 
 		 950 aa  104  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1175  branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.58 
 
 		 570 aa  103  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.139317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1078  branched chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.58 
 
 		 570 aa  103  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0441127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 290 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64890  putative permease of ABC branched chain amino acid transporter  30.29 
 
 		 304 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2539  ABC transporter-like protein  33.19 
 
 		 559 aa  102  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.119506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.45 
 
 		 316 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  31.88 
 
 		 593 aa  102  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 302 aa  102  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.13 
 
 		 316 aa  101  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.13 
 
 		 316 aa  101  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 292 aa  100  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0379  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livM  32.93 
 
 		 358 aa  100  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  30.13 
 
 		 316 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  28.93 
 
 		 643 aa  100  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.13 
 
 		 316 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 319 aa  100  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5562  ABC transporter related  28.03 
 
 		 891 aa  99.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  30.97 
 
 		 302 aa  98.6  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 290 aa  98.2  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5036  inner-membrane translocator  33.17 
 
 		 362 aa  98.2  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4378  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 294 aa  98.2  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 373 aa  97.8  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  29.45 
 
 		 304 aa  98.2  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 355 aa  97.8  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  27.24 
 
 		 304 aa  97.8  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 304 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1156  inner-membrane translocator  36.32 
 
 		 354 aa  96.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.412429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 316 aa  96.3  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  27.67 
 
 		 311 aa  96.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.49 
 
 		 316 aa  96.3  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 562 aa  96.7  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4005  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 384 aa  96.3  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.89 
 
 		 308 aa  96.3  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  29.49 
 
 		 316 aa  95.9  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  29.49 
 
 		 316 aa  95.9  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  29.49 
 
 		 316 aa  95.9  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 316 aa  95.5  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  28.7 
 
 		 316 aa  95.1  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 316 aa  94.7  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 316 aa  94.7  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  25.59 
 
 		 646 aa  94.7  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 381 aa  94.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2722  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 358 aa  94.4  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  0.425385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  27.92 
 
 		 647 aa  94.4  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  25.59 
 
 		 646 aa  94.4  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 308 aa  94.4  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  28.42 
 
 		 590 aa  94  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1751  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 304 aa  94  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48853  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23000  branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  31.87 
 
 		 292 aa  93.6  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.135077  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 292 aa  93.2  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.54 
 
 		 308 aa  93.2  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2220  inner-membrane translocator  34.54 
 
 		 358 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120044  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.03 
 
 		 308 aa  92  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 302 aa  92.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0051  inner-membrane translocator  32.03 
 
 		 368 aa  92.4  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0217  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 358 aa  92  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  29.24 
 
 		 606 aa  92  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 		 302 aa  91.7  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 		 302 aa  91.7  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0118  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 358 aa  91.7  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  28.25 
 
 		 316 aa  91.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 289 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0601  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 358 aa  91.3  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 293 aa  91.3  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 293 aa  91.3  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5148  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  33.76 
 
 		 351 aa  91.3  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 291 aa  91.3  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.76 
 
 		 308 aa  90.9  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  25 
 
 		 300 aa  90.9  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.83 
 
 		 308 aa  90.9  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.76 
 
 		 308 aa  90.9  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  28.82 
 
 		 301 aa  90.9  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.76 
 
 		 308 aa  90.9  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>