More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1595 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  100 
 
 		 355 aa  689    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  51.7 
 
 		 352 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  50.43 
 
 		 352 aa  315  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  49.72 
 
 		 352 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  48.84 
 
 		 349 aa  306  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  46.94 
 
 		 346 aa  279  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  47.69 
 
 		 345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  41.62 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  46.45 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  45.32 
 
 		 349 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  41.33 
 
 		 350 aa  268  8.999999999999999e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  43.01 
 
 		 373 aa  265  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  41.04 
 
 		 350 aa  264  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  47.63 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1863  inner-membrane translocator  46.72 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2306  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 357 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0299  inner-membrane translocator  43.84 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658484  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3134  inner-membrane translocator  42.41 
 
 		 357 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.628981  normal  0.885727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4178  inner-membrane translocator  42.54 
 
 		 357 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2608  inner-membrane translocator  42.41 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5717  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  41.64 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1834  inner-membrane translocator  44.13 
 
 		 357 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3414  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.29 
 
 		 357 aa  242  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1545  inner-membrane translocator  46.13 
 
 		 358 aa  239  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.137578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2374  inner-membrane translocator  47.21 
 
 		 356 aa  236  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4574  inner-membrane translocator  43.84 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0217  inner-membrane translocator  43.79 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0252  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 358 aa  233  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.231195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  42.94 
 
 		 358 aa  233  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000401  branched-chain amino acid transport system permease protein livM  41.21 
 
 		 355 aa  232  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241122  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0263  inner-membrane translocator  43.21 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1567  inner-membrane translocator  42.98 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394848  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5009  inner-membrane translocator  41.48 
 
 		 354 aa  226  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2440  inner-membrane translocator  44.57 
 
 		 356 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1557  inner-membrane translocator  43.27 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.505429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0467  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193008  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2722  inner-membrane translocator  41.41 
 
 		 358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  0.425385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3610  inner-membrane translocator  39.55 
 
 		 358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963885  normal  0.413755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0458  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 358 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441083  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0601  inner-membrane translocator  42.19 
 
 		 358 aa  216  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5289  inner-membrane translocator  37.36 
 
 		 357 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.975087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3362  inner-membrane translocator  39.55 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3539  inner-membrane translocator  42.7 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.17747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1156  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.412429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3437  inner-membrane translocator  42.29 
 
 		 354 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  40.99 
 
 		 358 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0551  inner-membrane translocator  45.03 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5036  inner-membrane translocator  41.11 
 
 		 362 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 358 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0784  inner-membrane translocator  39.49 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.1 
 
 		 325 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43520  amino acid ABC transporter-like protein  41.48 
 
 		 355 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00847282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  40.06 
 
 		 381 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0051  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0379  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livM  38.33 
 
 		 358 aa  192  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4939  inner-membrane translocator  39.88 
 
 		 358 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0118  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2220  inner-membrane translocator  39.55 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120044  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4005  inner-membrane translocator  39.01 
 
 		 384 aa  186  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0951  inner-membrane translocator  38.72 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2276  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.72 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.158559  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2750  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  43.48 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3003  inner-membrane translocator  43.79 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3011  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 370 aa  182  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5148  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  41.14 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2988  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.67 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  34.85 
 
 		 415 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  39.81 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.8 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 407 aa  172  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 360 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  39.75 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  38.38 
 
 		 589 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 327 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0891  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7158  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  43.9 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 407 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 353 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0678  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 314 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2546  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.79 
 
 		 365 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4243  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0351  inner-membrane translocator  39.92 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0132915  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4551  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 314 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 562 aa  160  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1741  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 336 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0493356  normal  0.156459 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43760  LivM family inner-membrane translocator  40.88 
 
 		 352 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205767  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 435 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>