More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3350 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3350  inner-membrane translocator  100 
 
 		 659 aa  1232    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5664  inner-membrane translocator  49.76 
 
 		 741 aa  488  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269421  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0855  inner-membrane translocator  49.11 
 
 		 772 aa  474  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.852549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8833  inner-membrane translocator  47.98 
 
 		 637 aa  402  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.756263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  32.42 
 
 		 898 aa  170  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4038  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 816 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 704 aa  163  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  31.14 
 
 		 989 aa  157  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3222  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 684 aa  153  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 697 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2952  ABC transporter related  30.23 
 
 		 930 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  31.64 
 
 		 940 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  32.06 
 
 		 924 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  30.53 
 
 		 956 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0381  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 692 aa  128  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4486  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 661 aa  125  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8309  inner-membrane translocator  30.11 
 
 		 652 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 292 aa  123  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  33.18 
 
 		 1302 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2539  ABC transporter-like protein  38.12 
 
 		 559 aa  115  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.119506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3489  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 743 aa  111  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1283  ABC transporter related  30.44 
 
 		 1087 aa  104  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.887426  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.62 
 
 		 646 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  31.62 
 
 		 646 aa  98.6  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 291 aa  97.8  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  31.76 
 
 		 643 aa  96.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.21 
 
 		 290 aa  91.3  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5562  ABC transporter related  27.5 
 
 		 891 aa  90.9  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 292 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  25.36 
 
 		 656 aa  90.1  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.36 
 
 		 603 aa  89.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1175  branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.9 
 
 		 570 aa  88.6  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.139317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1078  branched chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.9 
 
 		 570 aa  88.2  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0441127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 337 aa  87.8  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  32.76 
 
 		 647 aa  87.8  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1781  ABC transporter permease  32.36 
 
 		 287 aa  87.4  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0603975  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 294 aa  87  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  31.78 
 
 		 648 aa  87  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 603 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  29.52 
 
 		 328 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  28.83 
 
 		 642 aa  85.9  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  29.57 
 
 		 291 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  29.91 
 
 		 643 aa  86.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  29.96 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1035  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.37 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.977456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0601  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 373 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.73 
 
 		 325 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  28.07 
 
 		 603 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  29 
 
 		 603 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  36.33 
 
 		 908 aa  82.8  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  30.3 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 326 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1160  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.625358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  28.07 
 
 		 603 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4821  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0314054  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0772  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.136837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  29.4 
 
 		 628 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23000  branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  30.23 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.135077  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.29 
 
 		 523 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5717  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  29.01 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4242  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 292 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 302 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4712  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 348 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  29.22 
 
 		 291 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1288  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 294 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  29.23 
 
 		 663 aa  78.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1004  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0350  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.018915  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1505  inner-membrane translocator  31.55 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  30.05 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0505  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0978839  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  29.89 
 
 		 590 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3084  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 623 aa  77.4  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00985997  normal  0.0142053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4898  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0477  inner-membrane translocator  28.11 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000104814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  29.34 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0351  inner-membrane translocator  28 
 
 		 345 aa  76.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0132915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3375  inner-membrane translocator  29.76 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  31.3 
 
 		 338 aa  76.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 316 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.66 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 290 aa  75.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1386  inner-membrane translocator  27.83 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  28.29 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  28.16 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.01 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  34.02 
 
 		 679 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2306  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  31 
 
 		 594 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>