More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4898 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4898  inner-membrane translocator  100 
 
 
342 aa  646    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  62.62 
 
 
382 aa  341  9e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  57.8 
 
 
338 aa  335  9e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  47.39 
 
 
287 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  45.21 
 
 
296 aa  219  7e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
288 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
288 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  42.91 
 
 
289 aa  199  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  41.75 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  37.35 
 
 
481 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3008  inner-membrane translocator  42.96 
 
 
288 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2888  inner-membrane translocator  38.84 
 
 
446 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0108  inner-membrane translocator  39.31 
 
 
493 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2098  inner-membrane translocator  37.18 
 
 
373 aa  172  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0236105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2203  inner-membrane translocator  42.16 
 
 
492 aa  172  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  37 
 
 
308 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.33 
 
 
319 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  42.05 
 
 
422 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  36.67 
 
 
308 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.67 
 
 
308 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.67 
 
 
308 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  36.21 
 
 
308 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
319 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
308 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
308 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
319 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
308 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  32.44 
 
 
298 aa  169  9e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  35.25 
 
 
308 aa  168  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1231  inner-membrane translocator  36.39 
 
 
431 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1158  inner-membrane translocator  34.47 
 
 
446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  38.18 
 
 
289 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  37.15 
 
 
302 aa  165  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.51 
 
 
291 aa  162  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  34 
 
 
300 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1972  inner-membrane translocator  39.18 
 
 
462 aa  159  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79466  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  35.1 
 
 
308 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  34.71 
 
 
302 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  35.76 
 
 
308 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.91 
 
 
308 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  32.45 
 
 
308 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  35.33 
 
 
301 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  33.9 
 
 
293 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  32.45 
 
 
308 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  34.35 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  33.11 
 
 
308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
304 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.23 
 
 
308 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  35.09 
 
 
287 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  33.1 
 
 
293 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  35.43 
 
 
308 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.11 
 
 
308 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 
298 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  32.99 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  35.57 
 
 
304 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.02 
 
 
298 aa  153  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  32.89 
 
 
303 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1470  inner-membrane translocator  35.14 
 
 
322 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
307 aa  153  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
302 aa  152  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  33.56 
 
 
291 aa  152  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  32.99 
 
 
302 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.78 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 
298 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.78 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.78 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1740  inner-membrane translocator  35.56 
 
 
370 aa  152  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3840  inner-membrane translocator  38.46 
 
 
288 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.927724  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  33.9 
 
 
304 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3963  inner-membrane translocator  38.46 
 
 
288 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  33.79 
 
 
304 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64890  putative permease of ABC branched chain amino acid transporter  32.43 
 
 
304 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
298 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.53 
 
 
293 aa  150  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  37.15 
 
 
295 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  34.69 
 
 
297 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33 
 
 
308 aa  149  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3846  inner-membrane translocator  35.43 
 
 
307 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221591  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.89 
 
 
308 aa  149  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  36.04 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.77 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  36.39 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  34.74 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  32.89 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1247  inner-membrane translocator  34.11 
 
 
307 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0734  inner-membrane translocator  35.74 
 
 
324 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993171  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4109  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.180327  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4415  inner-membrane translocator  34.74 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  36.27 
 
 
311 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4394  inner-membrane translocator  34.74 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  33.78 
 
 
305 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3086  inner-membrane translocator  33.03 
 
 
370 aa  146  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
291 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4260  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  35.06 
 
 
310 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26120  ABC-transporter permease protein  35.14 
 
 
304 aa  146  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000346731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  34.56 
 
 
301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  33.11 
 
 
301 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  36.75 
 
 
305 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.446123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>