More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1158 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1231  inner-membrane translocator  88.86 
 
 		 431 aa  755    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1158  inner-membrane translocator  100 
 
 		 446 aa  870    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546012  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2203  inner-membrane translocator  44.39 
 
 		 492 aa  294  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2888  inner-membrane translocator  48.85 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  45.37 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0108  inner-membrane translocator  39.11 
 
 		 493 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3013  inner-membrane translocator  39.67 
 
 		 500 aa  256  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.265613  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  36.29 
 
 		 481 aa  256  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1972  inner-membrane translocator  52.04 
 
 		 462 aa  247  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3158  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 518 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 338 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  40.08 
 
 		 289 aa  167  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  38.3 
 
 		 296 aa  163  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 382 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 287 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.48 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2098  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0236105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 290 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0507  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 291 aa  144  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3086  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 370 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1740  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 289 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.88 
 
 		 289 aa  133  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  32 
 
 		 294 aa  133  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4898  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 342 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 292 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 294 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  30.3 
 
 		 308 aa  127  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.64 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.64 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.64 
 
 		 298 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3008  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 288 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 294 aa  123  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.67 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  27.85 
 
 		 300 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 300 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  30.13 
 
 		 319 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.67 
 
 		 302 aa  121  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  30.13 
 
 		 319 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.81 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  29.73 
 
 		 300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  28.77 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 308 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 		 291 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 308 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4744  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  hitchhiker  0.000000155208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4866  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  hitchhiker  0.000815383 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  29.9 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4922  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 304 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.75867  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.9 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.9 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1838  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  31.54 
 
 		 304 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 304 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4658  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 304 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026431 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1979  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  28.62 
 
 		 305 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 287 aa  116  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0553  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0455233  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  29.26 
 
 		 308 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  30.49 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  29.58 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 291 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 302 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 291 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3202  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 338 aa  113  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 294 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 290 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 291 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 294 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  28.2 
 
 		 305 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6070  inner-membrane translocator  28.07 
 
 		 286 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  29.93 
 
 		 293 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 294 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.33 
 
 		 294 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  28.71 
 
 		 309 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64890  putative permease of ABC branched chain amino acid transporter  28.86 
 
 		 304 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>