More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2203 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2203  inner-membrane translocator  100 
 
 		 492 aa  935    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1972  inner-membrane translocator  53.98 
 
 		 462 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0108  inner-membrane translocator  46.51 
 
 		 493 aa  341  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1231  inner-membrane translocator  43.91 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1158  inner-membrane translocator  44.39 
 
 		 446 aa  316  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546012  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  40.55 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 422 aa  259  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3013  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 500 aa  236  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.265613  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2888  inner-membrane translocator  38.93 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3158  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 518 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  41.52 
 
 		 296 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 338 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  40.62 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 287 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4898  inner-membrane translocator  42.16 
 
 		 342 aa  156  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 288 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 288 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 289 aa  149  8e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 290 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0507  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 291 aa  147  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3008  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 288 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3086  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 370 aa  137  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1740  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 370 aa  136  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.01 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2098  inner-membrane translocator  30.09 
 
 		 373 aa  130  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0236105 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.11 
 
 		 292 aa  127  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.63 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 290 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 311 aa  123  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.37 
 
 		 319 aa  123  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 316 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 302 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.7 
 
 		 308 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 308 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  31.7 
 
 		 308 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 308 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.7 
 
 		 308 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 308 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.76 
 
 		 316 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  31.44 
 
 		 308 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.56 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.19 
 
 		 316 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  31.08 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 		 316 aa  118  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 316 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 289 aa  118  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 316 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.28 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  31.13 
 
 		 316 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.95 
 
 		 294 aa  117  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.13 
 
 		 316 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 316 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 316 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 316 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 316 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 302 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.1 
 
 		 290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.1 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  27.85 
 
 		 300 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 307 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  30.93 
 
 		 293 aa  114  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 300 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 304 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  31 
 
 		 304 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 294 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 303 aa  113  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  28.25 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  28.25 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.76 
 
 		 299 aa  112  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 		 298 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 300 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5538  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 292 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 304 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 293 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 		 298 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.67 
 
 		 291 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  29.24 
 
 		 304 aa  110  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 290 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2926  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.66 
 
 		 336 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  28.91 
 
 		 300 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 308 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.16 
 
 		 308 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 338 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  27.92 
 
 		 308 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64890  putative permease of ABC branched chain amino acid transporter  28.09 
 
 		 304 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.16 
 
 		 308 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>