More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3966 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  100 
 
 
382 aa  719    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  62.71 
 
 
338 aa  361  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4898  inner-membrane translocator  62.62 
 
 
342 aa  312  5.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  42.96 
 
 
287 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  44.06 
 
 
296 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  44.01 
 
 
288 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  44.01 
 
 
288 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  44.13 
 
 
289 aa  209  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  44.21 
 
 
290 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  39.09 
 
 
481 aa  190  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3008  inner-membrane translocator  43.48 
 
 
288 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  41.94 
 
 
422 aa  186  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2888  inner-membrane translocator  41.67 
 
 
446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  38.49 
 
 
289 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1231  inner-membrane translocator  36.5 
 
 
431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1158  inner-membrane translocator  35.58 
 
 
446 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546012  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1740  inner-membrane translocator  38.48 
 
 
370 aa  170  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2098  inner-membrane translocator  36.08 
 
 
373 aa  169  7e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0236105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1979  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  35.41 
 
 
305 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0108  inner-membrane translocator  37.83 
 
 
493 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3086  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
370 aa  166  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  32.76 
 
 
300 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.68 
 
 
319 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  35 
 
 
308 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2203  inner-membrane translocator  40.62 
 
 
492 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  35.02 
 
 
308 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  35.35 
 
 
308 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0507  inner-membrane translocator  38.85 
 
 
291 aa  157  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.35 
 
 
308 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.35 
 
 
308 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1547  inner-membrane translocator  41.49 
 
 
287 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  35.35 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  34.16 
 
 
287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  35.35 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  34.68 
 
 
308 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  34.68 
 
 
308 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  35.35 
 
 
308 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  35.33 
 
 
308 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1972  inner-membrane translocator  38.7 
 
 
462 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79466  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  35.76 
 
 
293 aa  152  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  34.98 
 
 
287 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  33.79 
 
 
308 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  35.47 
 
 
294 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  38.44 
 
 
309 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  36.21 
 
 
302 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  35.9 
 
 
289 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1148  inner-membrane translocator  36.79 
 
 
319 aa  149  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  35.43 
 
 
308 aa  149  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  35.43 
 
 
308 aa  149  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.98 
 
 
292 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4415  inner-membrane translocator  36.48 
 
 
310 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.23 
 
 
308 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4260  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  36.16 
 
 
310 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  34.33 
 
 
308 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2166  inner-membrane translocator  35.94 
 
 
286 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4394  inner-membrane translocator  36.48 
 
 
310 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3929  inner-membrane translocator  35.83 
 
 
333 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  32.77 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
302 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  35.33 
 
 
308 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 
298 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 
298 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  34.46 
 
 
300 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  33.45 
 
 
287 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
302 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  34.14 
 
 
302 aa  144  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
291 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  34.97 
 
 
316 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 
298 aa  142  7e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2158  inner-membrane translocator  34.5 
 
 
336 aa  142  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699137  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 
291 aa  142  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  32.26 
 
 
287 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.42 
 
 
294 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3104  inner-membrane translocator  32.24 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.89 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  33.55 
 
 
308 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.39 
 
 
298 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.44 
 
 
298 aa  140  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  36.07 
 
 
289 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 
289 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
293 aa  139  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2926  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.76 
 
 
336 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  36.81 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  34.93 
 
 
292 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3963  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
288 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1571  inner-membrane translocator  36.76 
 
 
336 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.350199  normal  0.598455 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0734  inner-membrane translocator  35.11 
 
 
324 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993171  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  34.68 
 
 
304 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
301 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  33.79 
 
 
304 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.56 
 
 
308 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  38.46 
 
 
287 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  36.89 
 
 
290 aa  138  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.56 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  32.87 
 
 
293 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5975  inner-membrane translocator  35.82 
 
 
285 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  34.36 
 
 
297 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3416  inner-membrane translocator  39.37 
 
 
290 aa  137  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.22 
 
 
308 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.22 
 
 
308 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>