More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3008 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3008  inner-membrane translocator  100 
 
 		 288 aa  556  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  85.47 
 
 		 289 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  69.15 
 
 		 287 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  67.71 
 
 		 288 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  67.71 
 
 		 288 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  68.97 
 
 		 290 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  58.36 
 
 		 296 aa  323  2e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  43.01 
 
 		 289 aa  219  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 382 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3840  inner-membrane translocator  41.01 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.927724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3963  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  38.31 
 
 		 481 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4898  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1547  inner-membrane translocator  40.49 
 
 		 287 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2098  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0236105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1231  inner-membrane translocator  38.93 
 
 		 431 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126142 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1979  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  34.88 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1275  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.732042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3416  inner-membrane translocator  40.86 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1740  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 370 aa  155  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3086  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 370 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.88 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 291 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  34.16 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2888  inner-membrane translocator  38.25 
 
 		 446 aa  149  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 422 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3929  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 333 aa  148  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1158  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 446 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546012  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  32.55 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.52 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1518  hypothetical protein  33.75 
 
 		 336 aa  145  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.442526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.67 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.67 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2158  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 336 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1148  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 319 aa  143  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 304 aa  142  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  32.16 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2926  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.92 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1571  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.350199  normal  0.598455 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 		 293 aa  142  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1972  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 462 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  31.76 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  31.76 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2203  inner-membrane translocator  38.25 
 
 		 492 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3013  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 500 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.265613  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2031  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 321 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.74 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.94 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0562  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.6 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000395918  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0923  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 336 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161069  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0507  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5975  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  33.11 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  30.31 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0734  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993171  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 291 aa  132  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 338 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.04 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>