More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1547 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1547  inner-membrane translocator  100 
 
 		 287 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3963  inner-membrane translocator  62.24 
 
 		 288 aa  332  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3840  inner-membrane translocator  62.24 
 
 		 288 aa  329  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.927724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3416  inner-membrane translocator  55.48 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  40.57 
 
 		 289 aa  182  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  40.93 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  41.07 
 
 		 289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3008  inner-membrane translocator  40.49 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  42.2 
 
 		 382 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  34.84 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  40.73 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1979  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  33.44 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1148  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2158  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4470  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4898  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 342 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1275  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 336 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.732042 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2098  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 373 aa  122  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0236105 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1740  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 370 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1518  hypothetical protein  33.65 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.442526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 422 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3086  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.64 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3929  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0332  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2926  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.38 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 338 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1761  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 319 aa  112  6e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328925  hitchhiker  0.000752559 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1571  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 336 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.350199  normal  0.598455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2270  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  28.87 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1829  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0923  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161069  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2888  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 446 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1582  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.99 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  30.92 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  28.28 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.99 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.57 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0586  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6411  inner-membrane translocator  37 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0041004  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6644  inner-membrane translocator  37 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.901736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.99 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6242  inner-membrane translocator  37 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.426254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  33.45 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.44 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2918  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2493  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.57 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.57 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.57 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  31.77 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3013  inner-membrane translocator  32.31 
 
 		 500 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.265613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  29.24 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  30.71 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  31.85 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.42 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3794  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.192822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 603 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 603 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  28.83 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>