More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6242 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6242  inner-membrane translocator  100 
 
 		 297 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.426254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6411  inner-membrane translocator  99.66 
 
 		 297 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0041004  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6644  inner-membrane translocator  99.66 
 
 		 297 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.901736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3391  inner-membrane translocator  97.31 
 
 		 297 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720694  normal  0.830415 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1829  inner-membrane translocator  51.18 
 
 		 297 aa  271  8.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4470  inner-membrane translocator  53.87 
 
 		 297 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  30.53 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  29.89 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1518  hypothetical protein  29.97 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.442526 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3929  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2158  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1979  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  29.81 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3008  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 288 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1972  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 462 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1275  inner-membrane translocator  29.52 
 
 		 336 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.732042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1231  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 431 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1547  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  30.32 
 
 		 289 aa  99.4  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0108  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 493 aa  97.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1158  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 446 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546012  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1571  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 336 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.350199  normal  0.598455 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2926  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.19 
 
 		 336 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  28.57 
 
 		 481 aa  92  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3963  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  33.48 
 
 		 422 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3840  inner-membrane translocator  31.18 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.927724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0923  inner-membrane translocator  28.66 
 
 		 336 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161069  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0507  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.76 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  29.69 
 
 		 300 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  27.48 
 
 		 302 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  28.95 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 382 aa  85.5  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.73 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  27.36 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  27.87 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.73 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  29.75 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  28.03 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  29.74 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  28.06 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  28.38 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  28.85 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.51 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  30.07 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.84 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  29.84 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.84 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  29.14 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  28.66 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  26.54 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  25.43 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0562  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.45 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000395918  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  28.95 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3416  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  29.04 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  29.97 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7951  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296624  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  28.77 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  26.8 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4330  inner-membrane translocator  28.05 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.06779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5538  inner-membrane translocator  24.92 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4424  inner-membrane translocator  28.77 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.230334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  27.55 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  25.25 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4423  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240774  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  25.98 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  28.93 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  28.29 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  28.71 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.49 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>