More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1582 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1582  inner-membrane translocator  100 
 
 		 322 aa  621  1e-177  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0591  inner-membrane translocator  79.13 
 
 		 318 aa  509  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000340346 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1761  inner-membrane translocator  78.06 
 
 		 319 aa  490  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328925  hitchhiker  0.000752559 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0445  inner-membrane translocator  74.29 
 
 		 311 aa  435  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0317  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 323 aa  159  9e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1504  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.163157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0600  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0826  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1804  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.68636 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 287 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  30.52 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  30.52 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1979  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  29.52 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1740  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3086  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1231  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 431 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1158  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 446 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  29.21 
 
 		 481 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  29.49 
 
 		 319 aa  102  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  31.41 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2098  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0236105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3840  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.927724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3013  inner-membrane translocator  29.57 
 
 		 500 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.265613  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  27.85 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  30.75 
 
 		 301 aa  99.4  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1972  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 462 aa  99  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3963  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 382 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  28.25 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.3 
 
 		 298 aa  95.9  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.3 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0507  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2493  inner-membrane translocator  30.13 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.98 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.99 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  27.94 
 
 		 297 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.03 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1165  inner-membrane translocator  28.16 
 
 		 306 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.893809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2158  inner-membrane translocator  28.1 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0521  inner-membrane translocator  27.16 
 
 		 304 aa  89.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  26.82 
 
 		 297 aa  89.7  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  24.92 
 
 		 297 aa  89.7  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  28.35 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0108  inner-membrane translocator  27.54 
 
 		 493 aa  89.4  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  30.97 
 
 		 301 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0563  inner-membrane translocator  29.11 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  29.49 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  27.15 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  26.02 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  25.48 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1547  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  25 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  27.55 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6102  inner-membrane translocator  28.71 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  29.64 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  27.39 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  30.62 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.84 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2888  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 446 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1148  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 319 aa  85.9  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  25.71 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  26.1 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  26.18 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  27.04 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  25.66 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  27.74 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2307  inner-membrane translocator  30.27 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2651  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000892409  hitchhiker  0.00872106 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  25.66 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  27.44 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  25.66 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1470  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  27.04 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  27.94 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  29.37 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1577  inner-membrane translocator  29 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  28.94 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.04 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.04 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  27.04 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.04 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.04 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0734  inner-membrane translocator  29.78 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993171  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  27.04 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>