More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0826 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0826  inner-membrane translocator  100 
 
 		 318 aa  613  1e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1504  inner-membrane translocator  66.56 
 
 		 321 aa  380  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.163157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0317  inner-membrane translocator  53.21 
 
 		 323 aa  301  7.000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1804  inner-membrane translocator  52.88 
 
 		 323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.68636 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1582  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0600  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1761  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328925  hitchhiker  0.000752559 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0591  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000340346 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0445  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1979  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  31.45 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  28.85 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 422 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 289 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  28.24 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  28.35 
 
 		 481 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 289 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  30.2 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  26.63 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1972  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 462 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2098  inner-membrane translocator  27.52 
 
 		 373 aa  91.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0236105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 300 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3086  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 370 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 652 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 291 aa  90.5  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0507  inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 291 aa  90.1  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  29.14 
 
 		 294 aa  90.1  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  30.92 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 325 aa  89.7  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1940  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  29.78 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1275  inner-membrane translocator  29.49 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.732042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2888  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 446 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  28.34 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  28.66 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3008  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  27.24 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1518  hypothetical protein  31.23 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.442526 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  26.94 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1740  inner-membrane translocator  29.31 
 
 		 370 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  26.82 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.14 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3831  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  29.93 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.73 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2493  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  31 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  28.15 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  31.41 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  26.1 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.95 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4423  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  27.55 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  28.25 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  27.13 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  29.74 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  27.13 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  27.24 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  29.7 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  27.92 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2651  inner-membrane translocator  27.53 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000892409  hitchhiker  0.00872106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  30.35 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1547  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5602  inner-membrane translocator  29.64 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3929  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3399  inner-membrane translocator  29.73 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  27.42 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  29 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2918  inner-membrane translocator  28.14 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.52 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2158  inner-membrane translocator  29.56 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0521  inner-membrane translocator  27.63 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  26.76 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.38 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 290 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  27.67 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0734  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993171  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4104  inner-membrane translocator  27.06 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  25.62 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>