More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0445 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0445  inner-membrane translocator  100 
 
 		 311 aa  600  1e-170  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0591  inner-membrane translocator  76.14 
 
 		 318 aa  472  1e-132  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000340346 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1761  inner-membrane translocator  73.9 
 
 		 319 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328925  hitchhiker  0.000752559 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1582  inner-membrane translocator  74.29 
 
 		 322 aa  456  1e-127  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0317  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1504  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.163157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1804  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.68636 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0600  inner-membrane translocator  34 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0826  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  30 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  30 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1231  inner-membrane translocator  33 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  28.28 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3086  inner-membrane translocator  29.32 
 
 		 370 aa  99.8  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1740  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 370 aa  99.4  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  28.03 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  27.62 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  26.11 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  29.28 
 
 		 481 aa  96.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1158  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 446 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1165  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.893809 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0563  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 306 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0521  inner-membrane translocator  26.64 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0507  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  28.28 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  28.25 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1979  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  28.85 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2098  inner-membrane translocator  27.19 
 
 		 373 aa  92.4  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0236105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2158  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 336 aa  92.4  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.54 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  30 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  26.85 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0108  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 493 aa  89.7  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  29.11 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 422 aa  89.7  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  26.98 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.45 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  28.12 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2651  inner-membrane translocator  27.3 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000892409  hitchhiker  0.00872106 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3963  inner-membrane translocator  31.47 
 
 		 288 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  28.41 
 
 		 289 aa  86.7  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  26.83 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.68 
 
 		 297 aa  86.3  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1571  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 336 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.350199  normal  0.598455 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  29.04 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3104  inner-membrane translocator  28.31 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  24.92 
 
 		 300 aa  85.9  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2926  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.86 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2888  inner-membrane translocator  29.56 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5538  inner-membrane translocator  26.54 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2611  inner-membrane translocator  26.52 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.404951  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1275  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.732042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  30.2 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3840  inner-membrane translocator  29.88 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.927724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  27.3 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.14 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  26.75 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1518  hypothetical protein  28.83 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.442526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  27.7 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  28 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  25.87 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2493  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.35 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.8 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  26.98 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  26.96 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.02 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  26.16 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  31 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.96 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  27.42 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  27.99 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1972  inner-membrane translocator  30 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  27.99 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  29.32 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  29.02 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.53 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  28.39 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.09 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1547  inner-membrane translocator  28.92 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  26.86 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  25.55 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  25.55 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2472  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  25.55 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.39 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  26.47 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>