More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1504 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1504  inner-membrane translocator  100 
 
 		 321 aa  617  1e-176  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.163157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0826  inner-membrane translocator  67.1 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0317  inner-membrane translocator  49.53 
 
 		 323 aa  300  2e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1804  inner-membrane translocator  49.06 
 
 		 323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.68636 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0600  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1761  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328925  hitchhiker  0.000752559 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0591  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000340346 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1582  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0445  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1979  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  31.23 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.82 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  29.04 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  28.35 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  28.35 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1972  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 462 aa  98.6  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  27.61 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1518  hypothetical protein  31.79 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.442526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  30.68 
 
 		 422 aa  96.7  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 287 aa  95.9  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3086  inner-membrane translocator  28.78 
 
 		 370 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1740  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  29.57 
 
 		 481 aa  92.8  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 290 aa  92.4  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  28.34 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1275  inner-membrane translocator  27.44 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.732042 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1577  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2158  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  27.73 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  28.9 
 
 		 291 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  28.12 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  28.76 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  27.86 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  29.22 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  27.74 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  28.46 
 
 		 289 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  28.9 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0108  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 493 aa  86.3  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  30.26 
 
 		 301 aa  86.3  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  27.48 
 
 		 301 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  26.35 
 
 		 292 aa  86.3  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2529  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 345 aa  85.9  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.658317  normal  0.422906 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  28.05 
 
 		 294 aa  85.9  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  25.72 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  27.04 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  27.6 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  31.17 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6117  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.41 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3399  inner-membrane translocator  27.69 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  27.81 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  25.95 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3008  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0507  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  27.59 
 
 		 652 aa  82.8  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0332  inner-membrane translocator  28.01 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0847  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  26.57 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  26.71 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  26.77 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3929  inner-membrane translocator  27.86 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.61 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2204  inner-membrane translocator  28.93 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  24.09 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2888  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4423  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.81 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  26.37 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2098  inner-membrane translocator  28.94 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0236105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  30.31 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  27.89 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4296  inner-membrane translocator  28.17 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.4 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  26.4 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.4 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  29.73 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  30.94 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3840  inner-membrane translocator  27.15 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.927724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  28.39 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1940  inner-membrane translocator  26.32 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  27.02 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.09 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1364  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0649  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.2 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.71 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3731  inner-membrane translocator  27.54 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  28.9 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>