More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2204 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2204  inner-membrane translocator  100 
 
 		 293 aa  568  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0780  inner-membrane translocator  49.31 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529329  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 287 aa  148  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 		 287 aa  142  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 		 287 aa  142  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.77 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  34.51 
 
 		 288 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.67 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  29.76 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 292 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  27.21 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  28.83 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3399  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4423  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240774  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2331  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.729625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3459  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.411869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.6 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  28.28 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  29.73 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.67 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.03 
 
 		 603 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  29.79 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  29.53 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 603 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 603 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  28.73 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 603 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  26.44 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 603 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.22 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.06 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.66 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0332  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  27.46 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  27.96 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.42 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  27.99 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.42 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5242  ABC transporter permease  32.45 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.157706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  27.99 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.99 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  27.99 
 
 		 319 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  27.99 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  27.99 
 
 		 319 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.99 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  30.27 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  29.8 
 
 		 316 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.42 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2270  inner-membrane translocator  28.72 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4887  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.07 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>