More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2425 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
288 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  99.31 
 
 
288 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  99.31 
 
 
288 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  84.72 
 
 
288 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  76.31 
 
 
288 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  63.86 
 
 
289 aa  320  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  49.66 
 
 
308 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0313  inner-membrane translocator  48.62 
 
 
291 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0852  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  64.54 
 
 
289 aa  275  7e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  42.2 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  44.6 
 
 
290 aa  232  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  41.84 
 
 
290 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.46 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  44.44 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  40.07 
 
 
290 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  40.78 
 
 
290 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.36 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.76 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.76 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.36 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  39.16 
 
 
294 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  39.16 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  38.25 
 
 
287 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  39.79 
 
 
292 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  41.4 
 
 
292 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  42.11 
 
 
305 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  39.79 
 
 
292 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  41.4 
 
 
292 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  44.77 
 
 
285 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0005  inner-membrane translocator  41.7 
 
 
294 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901395  hitchhiker  0.00000431174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  40.77 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  40 
 
 
291 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  39.34 
 
 
277 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0802  inner-membrane translocator  42.86 
 
 
286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  39.18 
 
 
296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  36.84 
 
 
287 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  40 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  36.46 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.65 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  39.86 
 
 
325 aa  171  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  36.65 
 
 
290 aa  171  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
293 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2331  inner-membrane translocator  39.35 
 
 
300 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.729625  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  38.65 
 
 
288 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0327  inner-membrane translocator  40.56 
 
 
293 aa  169  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0975712  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  36.59 
 
 
290 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  40.28 
 
 
290 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  37.28 
 
 
290 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  40 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  35.74 
 
 
294 aa  165  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  35.07 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.56 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  36.12 
 
 
301 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 
298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5695  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418313 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 
298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  36.15 
 
 
301 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  36.46 
 
 
287 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 
298 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  37.11 
 
 
287 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  35.76 
 
 
291 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
300 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.24 
 
 
301 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  36.91 
 
 
300 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  33.92 
 
 
286 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0907  inner-membrane translocator  39.36 
 
 
292 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.794087  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  35.23 
 
 
301 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1601  inner-membrane translocator  33.57 
 
 
287 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  33.67 
 
 
308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5641  inner-membrane translocator  42.5 
 
 
289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.99 
 
 
293 aa  155  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  36.27 
 
 
290 aa  154  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  36.9 
 
 
294 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5975  inner-membrane translocator  36.4 
 
 
285 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 
289 aa  152  7e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  34.74 
 
 
294 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  35.31 
 
 
294 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  36.24 
 
 
290 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  33.76 
 
 
319 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.96 
 
 
603 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  36.43 
 
 
652 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 
299 aa  149  7e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  35.96 
 
 
603 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  36.24 
 
 
301 aa  148  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5536  inner-membrane translocator  35.34 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898761  hitchhiker  0.00000762258 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7434  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  34.04 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  35.96 
 
 
603 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
603 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  35.96 
 
 
603 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0513  inner-membrane translocator  34.56 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0503611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  36.64 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2284  inner-membrane translocator  36.93 
 
 
285 aa  145  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
300 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1139  inner-membrane translocator  32.28 
 
 
287 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  36.55 
 
 
299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  34.83 
 
 
291 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  36.3 
 
 
294 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  32.41 
 
 
291 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
298 aa  143  4e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.51 
 
 
291 aa  142  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>