More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2331 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2331  inner-membrane translocator  100 
 
 
300 aa  569  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.729625  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  83.39 
 
 
285 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0802  inner-membrane translocator  61.48 
 
 
286 aa  278  6e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  41 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  40.61 
 
 
288 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  40.23 
 
 
288 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0513  inner-membrane translocator  39.64 
 
 
309 aa  183  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0503611  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  39.29 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  40.61 
 
 
288 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  36.43 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 
287 aa  169  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 
287 aa  169  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  38.28 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  35.66 
 
 
308 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 
288 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0313  inner-membrane translocator  38.55 
 
 
291 aa  159  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.76 
 
 
288 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  37.74 
 
 
289 aa  155  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  38.08 
 
 
295 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0852  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.17 
 
 
289 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  36.64 
 
 
292 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  36.26 
 
 
292 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  34.26 
 
 
290 aa  149  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  34.11 
 
 
290 aa  148  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  36.86 
 
 
290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  35.25 
 
 
305 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  34.63 
 
 
294 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  35.25 
 
 
292 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 
294 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.62 
 
 
290 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  36.43 
 
 
296 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  35.71 
 
 
292 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
301 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.86 
 
 
603 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  34.86 
 
 
603 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  34.86 
 
 
603 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.11 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  37.35 
 
 
277 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  34.51 
 
 
603 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  34.04 
 
 
603 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  32.86 
 
 
287 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  32.37 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  33.98 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2302  inner-membrane translocator  33.59 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.418685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1543  inner-membrane translocator  33.89 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2918  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
290 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3399  inner-membrane translocator  35.07 
 
 
304 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1601  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0116  inner-membrane translocator  32.96 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  30.32 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0907  inner-membrane translocator  36.63 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.794087  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
288 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4442  inner-membrane translocator  34.47 
 
 
294 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  33.21 
 
 
291 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  37.25 
 
 
551 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  36.29 
 
 
548 aa  126  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  34.46 
 
 
319 aa  126  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  32.42 
 
 
295 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  35 
 
 
292 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 
301 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  31.79 
 
 
287 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.55 
 
 
296 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  31.93 
 
 
301 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0994  inner-membrane translocator  36.73 
 
 
642 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5536  inner-membrane translocator  31.85 
 
 
287 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898761  hitchhiker  0.00000762258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0327  inner-membrane translocator  31.73 
 
 
293 aa  123  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0975712  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.29 
 
 
558 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0300  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  36.29 
 
 
642 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247535  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1673  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.97 
 
 
292 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.82 
 
 
523 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1944  inner-membrane translocator  36.29 
 
 
642 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28187  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.06 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.72 
 
 
298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1139  inner-membrane translocator  34.97 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  28.62 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4018  inner-membrane translocator  34.89 
 
 
639 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.72 
 
 
298 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  35.63 
 
 
289 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2204  inner-membrane translocator  34.44 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  33.56 
 
 
301 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  35.52 
 
 
526 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  34.44 
 
 
301 aa  119  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  32.78 
 
 
524 aa  118  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  32.14 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  31.1 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  30.62 
 
 
652 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  31.18 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  30.42 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3057  inner-membrane translocator  35.02 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299271  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  31.29 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
524 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  32.36 
 
 
534 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  31.39 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 
298 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  29.29 
 
 
287 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5641  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
289 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7434  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  31.2 
 
 
287 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  36.4 
 
 
308 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5695  inner-membrane translocator  33.21 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>