More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1652 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  100 
 
 		 291 aa  555  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5602  inner-membrane translocator  60.14 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.07 
 
 		 291 aa  236  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0734  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 324 aa  213  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993171  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.24 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  42.63 
 
 		 316 aa  209  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3794  inner-membrane translocator  46.37 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.192822 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3907  inner-membrane translocator  46.37 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  40.55 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  40.55 
 
 		 291 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  39.23 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  40.89 
 
 		 293 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.77 
 
 		 292 aa  198  7.999999999999999e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.57 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5095  inner-membrane translocator  41.96 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00123813  normal  0.0753948 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  40 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  38.69 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  38.69 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_003296  RS01986  amino-acid transmembrane lipoprotein ABC transporter  46.37 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.230121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  39.34 
 
 		 309 aa  188  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  39.34 
 
 		 309 aa  188  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.83 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  37.83 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.58 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.83 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.28 
 
 		 289 aa  186  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  37.79 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  37 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  39.45 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 309 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.54 
 
 		 304 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  40 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  37.87 
 
 		 304 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  39.4 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2495  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  38.59 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.799542  hitchhiker  0.00275887 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 603 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 603 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 603 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.37 
 
 		 603 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  37.62 
 
 		 335 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  37.54 
 
 		 305 aa  178  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 287 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 309 aa  178  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  37.75 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1751  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48853  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  37.95 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2267  inner-membrane translocator  38.81 
 
 		 296 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0641115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 603 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3202  inner-membrane translocator  39.4 
 
 		 338 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 291 aa  176  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3095  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64890  putative permease of ABC branched chain amino acid transporter  37.17 
 
 		 304 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 304 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0332  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2270  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  36 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3900  inner-membrane translocator  39.47 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  38.68 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 317 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  40.39 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>