More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1676 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  100 
 
 
285 aa  530  1e-149  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2331  inner-membrane translocator  83.39 
 
 
300 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.729625  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0802  inner-membrane translocator  63.51 
 
 
286 aa  296  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  44.44 
 
 
288 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  44.06 
 
 
288 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  43.68 
 
 
288 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  43.3 
 
 
288 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  42.25 
 
 
287 aa  182  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.85 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  40.23 
 
 
283 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  37.14 
 
 
290 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
287 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
287 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0513  inner-membrane translocator  38.35 
 
 
309 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0503611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0313  inner-membrane translocator  40.84 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  39.22 
 
 
295 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  36.71 
 
 
308 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  39.69 
 
 
289 aa  158  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  38.93 
 
 
292 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.96 
 
 
288 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0852  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.05 
 
 
289 aa  156  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  35.32 
 
 
290 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  34.5 
 
 
290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  37.25 
 
 
290 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  38.17 
 
 
292 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.69 
 
 
290 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  38.57 
 
 
292 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  33.46 
 
 
294 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.9 
 
 
294 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.9 
 
 
294 aa  142  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7434  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  35.2 
 
 
287 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  41.86 
 
 
603 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  35.97 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1973  inner-membrane translocator  39.37 
 
 
300 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  34.89 
 
 
292 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  35.61 
 
 
292 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  33.86 
 
 
290 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0327  inner-membrane translocator  35.16 
 
 
293 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0975712  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  36.69 
 
 
292 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  36.43 
 
 
296 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  40.7 
 
 
603 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.31 
 
 
603 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  40.31 
 
 
603 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  40.31 
 
 
603 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  34.15 
 
 
301 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  35.11 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0116  inner-membrane translocator  33.7 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5536  inner-membrane translocator  35.08 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898761  hitchhiker  0.00000762258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1543  inner-membrane translocator  34.36 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2918  inner-membrane translocator  35.77 
 
 
290 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  33.92 
 
 
301 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5695  inner-membrane translocator  36.79 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2302  inner-membrane translocator  33.98 
 
 
289 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.418685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  32.49 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  35.63 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.04 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  35 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  33.57 
 
 
287 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  35.97 
 
 
288 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 
301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3399  inner-membrane translocator  36.01 
 
 
304 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.4 
 
 
298 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.4 
 
 
298 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  32.5 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  30.8 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  32.42 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.01 
 
 
296 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  34.59 
 
 
301 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  32.99 
 
 
301 aa  125  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 
298 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5641  inner-membrane translocator  38.13 
 
 
289 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  33.56 
 
 
319 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0005  inner-membrane translocator  32.3 
 
 
294 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901395  hitchhiker  0.00000431174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  34.69 
 
 
308 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  33.46 
 
 
325 aa  122  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  31.21 
 
 
311 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  36.16 
 
 
289 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  33.45 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2529  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.658317  normal  0.422906 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  35.06 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1601  inner-membrane translocator  32.17 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2204  inner-membrane translocator  36.93 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  35.79 
 
 
290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  35.77 
 
 
551 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  33.95 
 
 
308 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  33.95 
 
 
308 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  33.92 
 
 
287 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.58 
 
 
319 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  33.95 
 
 
308 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4442  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  34.32 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  30.67 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  34.44 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3057  inner-membrane translocator  35.41 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299271  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.32 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  33.95 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.32 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  33.95 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  31.67 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  31.67 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.320486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>