More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4423 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4423  inner-membrane translocator  100 
 
 		 277 aa  527  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6649  inner-membrane translocator  73.65 
 
 		 277 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.0600103 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5696  inner-membrane translocator  73.29 
 
 		 277 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0633933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2992  hypothetical protein  63.87 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1309  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  59.06 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5901  inner-membrane translocator  59.42 
 
 		 277 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134465 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0053  inner-membrane translocator  58.03 
 
 		 278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.29 
 
 		 291 aa  178  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4265  inner-membrane translocator  38.77 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271034  decreased coverage  0.00000610723 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0146  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 291 aa  168  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000678204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3820  inner-membrane translocator  36.5 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1288  inner-membrane translocator  37.55 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.8 
 
 		 520 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4291  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 288 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956454 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0700  inner-membrane translocator  38.37 
 
 		 522 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1505  inner-membrane translocator  36.8 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.23 
 
 		 558 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  34.55 
 
 		 543 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4451  branched chain amino acid ABC transporter permease  37.05 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0795745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.49 
 
 		 551 aa  139  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.8 
 
 		 537 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 524 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 537 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.41 
 
 		 545 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4842  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  41.1 
 
 		 346 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25148  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 524 aa  138  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  36.06 
 
 		 542 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  36.06 
 
 		 542 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  36.09 
 
 		 540 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 554 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.36 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4720  inner-membrane translocator  40.64 
 
 		 484 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149683  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4899  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.1 
 
 		 495 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0994  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 642 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2745  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.8 
 
 		 525 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.17 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 527 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 548 aa  135  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  33.33 
 
 		 542 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4634  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.64 
 
 		 495 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23273  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 526 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4427  inner-membrane translocator  38.81 
 
 		 529 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483913  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4150  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 545 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0589  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 500 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.892329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.94 
 
 		 545 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.94 
 
 		 550 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.82 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1954  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.25 
 
 		 297 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 534 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4886  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.09 
 
 		 529 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5758  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.663374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1989  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 524 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.517253  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4077  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64280  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.88 
 
 		 529 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00501395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 652 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  35.32 
 
 		 537 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 547 aa  128  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 526 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  38.81 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.93 
 
 		 528 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0350  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.33 
 
 		 539 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1774  inner-membrane translocator  31.41 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.682783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.74 
 
 		 523 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1944  inner-membrane translocator  37.9 
 
 		 642 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 287 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0731  putative amino acid ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 		 538 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2177  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34.07 
 
 		 540 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281547  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1422  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 526 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0300  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 		 642 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247535  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 551 aa  125  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.42 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1201  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 527 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2049  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 		 538 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81771  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2564  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 		 540 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10716  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4018  inner-membrane translocator  38.86 
 
 		 639 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3104  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 		 542 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3128  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 		 542 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5669  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.88 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3733  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4635  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3068  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 542 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.08 
 
 		 539 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1710  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.93 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0993  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 592 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  38.43 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1339  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  34.55 
 
 		 533 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.388899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1503  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.21 
 
 		 542 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0128621  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0879  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.84 
 
 		 539 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  37.08 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2793  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  36.53 
 
 		 515 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0430  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 539 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  36.23 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0909  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 539 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>