More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1989 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  69.94 
 
 
539 aa  659    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1989  inner-membrane translocator  100 
 
 
524 aa  1039    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.517253  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2793  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  70.96 
 
 
515 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2872  urea ABC transporter, permease protein UrtB  71.15 
 
 
533 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0183692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  69.51 
 
 
539 aa  654    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1339  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  70.76 
 
 
533 aa  633  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.388899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1422  inner-membrane translocator  70.87 
 
 
526 aa  626  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2745  urea ABC transporter, permease protein UrtB  68.56 
 
 
525 aa  619  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4886  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  65.24 
 
 
529 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4427  inner-membrane translocator  64.64 
 
 
529 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483913  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0589  inner-membrane translocator  65.7 
 
 
500 aa  597  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.892329  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0700  inner-membrane translocator  68.25 
 
 
522 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214465  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64280  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  67.8 
 
 
529 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00501395  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5580  branched-chain amino acid ABC transporter permease  68.01 
 
 
529 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4720  inner-membrane translocator  63.78 
 
 
484 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149683  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4634  urea ABC transporter, permease protein UrtB  64.41 
 
 
495 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23273  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4899  urea ABC transporter, permease protein UrtB  64.02 
 
 
495 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1201  inner-membrane translocator  50.38 
 
 
527 aa  462  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4842  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  75.29 
 
 
346 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25148  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  48.85 
 
 
526 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0879  urea ABC transporter, permease protein UrtB  52.32 
 
 
539 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  49.11 
 
 
524 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  51.42 
 
 
524 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0430  inner-membrane translocator  52.12 
 
 
539 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0909  inner-membrane translocator  52.12 
 
 
539 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  50.81 
 
 
526 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4013  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  50.98 
 
 
539 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0786  inner-membrane translocator  52.42 
 
 
539 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  48.01 
 
 
528 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0953  urea ABC transporter, permease protein UrtB  50 
 
 
549 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0797  urea ABC transporter, permease protein UrtB  52.22 
 
 
539 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0953  inner-membrane translocator  50.3 
 
 
545 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.794484  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2483  urea ABC transporter, permease protein UrtB  51.61 
 
 
540 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0698  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  53.33 
 
 
534 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0832776  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3932  urea ABC transporter, permease protein UrtB  55.76 
 
 
543 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2564  putative amino acid ABC transporter, permease protein  54.59 
 
 
540 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3068  putative amino acid ABC transporter, permease protein  54.59 
 
 
542 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1437  inner-membrane translocator  51.31 
 
 
525 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3128  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  54.59 
 
 
542 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1503  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  54.81 
 
 
542 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0128621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3104  putative amino acid ABC transporter, permease protein  54.59 
 
 
542 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  47.31 
 
 
515 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2177  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  54.59 
 
 
540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0731  putative amino acid ABC transporter, permease protein  54.59 
 
 
538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2049  putative amino acid ABC transporter, permease protein  54.59 
 
 
538 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3684  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  50.4 
 
 
552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0987  inner-membrane translocator  50.6 
 
 
553 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573252  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  50.49 
 
 
527 aa  405  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  44.77 
 
 
548 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2192  urea ABC transporter, permease protein UrtB  51.58 
 
 
543 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788858  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1869  urea ABC transporter, permease protein UrtB  51.16 
 
 
543 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180379  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2040  ABC transporter permease  51.37 
 
 
538 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.552564  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2252  urea ABC transporter, permease protein UrtB  49.6 
 
 
543 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842238  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  46.74 
 
 
537 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  48.51 
 
 
542 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  47.32 
 
 
558 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  49.28 
 
 
520 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  47.32 
 
 
542 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  48.47 
 
 
537 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0189  inner-membrane translocator  48.26 
 
 
567 aa  361  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  48.25 
 
 
537 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0993  inner-membrane translocator  45.76 
 
 
592 aa  360  4e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  46.5 
 
 
542 aa  359  6e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  45.47 
 
 
545 aa  359  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  40.78 
 
 
547 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  46.9 
 
 
523 aa  352  7e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0227  Fis family transcriptional regulator  44.51 
 
 
537 aa  352  8.999999999999999e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.903114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  48.84 
 
 
551 aa  352  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  44.65 
 
 
550 aa  349  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  45.4 
 
 
540 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  51.5 
 
 
545 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  44.79 
 
 
534 aa  346  6e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  43.54 
 
 
554 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4150  inner-membrane translocator  46.52 
 
 
545 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00882  Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  45.71 
 
 
538 aa  331  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1102  urea ABC transporter, permease protein UrtB  45.21 
 
 
561 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.59 
 
 
551 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  42.89 
 
 
543 aa  301  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  49.32 
 
 
297 aa  300  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  50.51 
 
 
292 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  51.19 
 
 
302 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  49.32 
 
 
296 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0994  inner-membrane translocator  41.27 
 
 
642 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3863  inner-membrane translocator  46.51 
 
 
308 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.343461  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1673  urea ABC transporter, permease protein UrtB  49.82 
 
 
292 aa  249  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1253  inner-membrane translocator  46.18 
 
 
308 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27605 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  45.92 
 
 
308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  45.85 
 
 
308 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1944  inner-membrane translocator  44.84 
 
 
642 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28187  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0655  branched chain amino acid ABC transporter permease  45.85 
 
 
308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0300  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  44.57 
 
 
642 aa  243  6e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247535  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5511  urea ABC transporter, permease protein UrtB  44.67 
 
 
308 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  45.7 
 
 
300 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2863  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.05 
 
 
388 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.99 
 
 
293 aa  240  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  43.54 
 
 
300 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3113  urea ABC transporter, permease protein UrtB  44.67 
 
 
307 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2974  putative branched-chain amino acid transport system permease protein  43.64 
 
 
307 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3866  inner-membrane translocator  43.99 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0594  urea ABC transporter, permease protein UrtB  44.33 
 
 
308 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0586972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>