More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3000 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  100 
 
 		 534 aa  1048    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  64.27 
 
 		 551 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  48.17 
 
 		 547 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  49.91 
 
 		 540 aa  477  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00882  Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  50.98 
 
 		 538 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  47.6 
 
 		 548 aa  438  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  47.5 
 
 		 537 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  50.47 
 
 		 554 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0227  Fis family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 537 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.903114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  46.75 
 
 		 542 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  49.8 
 
 		 542 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  49.21 
 
 		 537 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  45.89 
 
 		 558 aa  412  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1102  urea ABC transporter, permease protein UrtB  47.3 
 
 		 561 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  48.56 
 
 		 523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  48.57 
 
 		 542 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  45.93 
 
 		 550 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  45.44 
 
 		 545 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4150  inner-membrane translocator  49.71 
 
 		 545 aa  392  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  47 
 
 		 520 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  41.74 
 
 		 526 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  50.45 
 
 		 537 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  44.31 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  56.98 
 
 		 545 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  44.44 
 
 		 524 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  48.79 
 
 		 526 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  47.47 
 
 		 528 aa  348  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  46.49 
 
 		 527 aa  348  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.37 
 
 		 515 aa  347  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1201  inner-membrane translocator  41.51 
 
 		 527 aa  335  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0953  urea ABC transporter, permease protein UrtB  43.65 
 
 		 549 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  48.96 
 
 		 539 aa  334  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0953  inner-membrane translocator  44.23 
 
 		 545 aa  334  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.794484  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2192  urea ABC transporter, permease protein UrtB  44.98 
 
 		 543 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788858  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1869  urea ABC transporter, permease protein UrtB  45.1 
 
 		 543 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180379  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  43.09 
 
 		 539 aa  330  6e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3684  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.5 
 
 		 552 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4013  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.14 
 
 		 539 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2040  ABC transporter permease  47.25 
 
 		 538 aa  324  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.552564  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4427  inner-membrane translocator  43.15 
 
 		 529 aa  322  8e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483913  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0879  urea ABC transporter, permease protein UrtB  44.33 
 
 		 539 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0430  inner-membrane translocator  44.14 
 
 		 539 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0909  inner-membrane translocator  44.14 
 
 		 539 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0987  inner-membrane translocator  43.49 
 
 		 553 aa  319  7e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573252  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0698  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  43.44 
 
 		 534 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0832776  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2177  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  47.03 
 
 		 540 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0731  putative amino acid ABC transporter, permease protein  47.03 
 
 		 538 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0700  inner-membrane translocator  47.3 
 
 		 522 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2049  putative amino acid ABC transporter, permease protein  46.8 
 
 		 538 aa  317  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81771  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2564  putative amino acid ABC transporter, permease protein  46.8 
 
 		 540 aa  317  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10716  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1503  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.8 
 
 		 542 aa  316  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0128621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3104  putative amino acid ABC transporter, permease protein  46.8 
 
 		 542 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4886  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.4 
 
 		 529 aa  316  9e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3128  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.58 
 
 		 542 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0786  inner-membrane translocator  43.54 
 
 		 539 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64280  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.18 
 
 		 529 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00501395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3068  putative amino acid ABC transporter, permease protein  46.35 
 
 		 542 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0797  urea ABC transporter, permease protein UrtB  43.34 
 
 		 539 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2483  urea ABC transporter, permease protein UrtB  43.48 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2252  urea ABC transporter, permease protein UrtB  43.08 
 
 		 543 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3932  urea ABC transporter, permease protein UrtB  44.02 
 
 		 543 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2745  urea ABC transporter, permease protein UrtB  47.88 
 
 		 525 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1989  inner-membrane translocator  44.79 
 
 		 524 aa  307  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.517253  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0589  inner-membrane translocator  47.62 
 
 		 500 aa  306  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.892329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2793  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  43.11 
 
 		 515 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2872  urea ABC transporter, permease protein UrtB  43.31 
 
 		 533 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0183692  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1339  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  43.11 
 
 		 533 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.388899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1422  inner-membrane translocator  43.82 
 
 		 526 aa  302  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4720  inner-membrane translocator  48.62 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149683  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0993  inner-membrane translocator  46.85 
 
 		 592 aa  301  3e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5580  branched-chain amino acid ABC transporter permease  45.73 
 
 		 529 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0189  inner-membrane translocator  42.58 
 
 		 567 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.64 
 
 		 551 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1437  inner-membrane translocator  43.05 
 
 		 525 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4899  urea ABC transporter, permease protein UrtB  48.39 
 
 		 495 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4634  urea ABC transporter, permease protein UrtB  47.71 
 
 		 495 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23273  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  48.9 
 
 		 543 aa  286  8e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4842  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  54.73 
 
 		 346 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25148  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4018  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 639 aa  271  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0994  inner-membrane translocator  47.8 
 
 		 642 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  47.8 
 
 		 297 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1944  inner-membrane translocator  44.26 
 
 		 642 aa  256  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0300  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  47.48 
 
 		 642 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247535  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.64 
 
 		 293 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  43.48 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  47.42 
 
 		 302 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  46.13 
 
 		 292 aa  243  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  45.05 
 
 		 301 aa  239  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  45.3 
 
 		 296 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3866  inner-membrane translocator  45.3 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1673  urea ABC transporter, permease protein UrtB  46.67 
 
 		 292 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1253  inner-membrane translocator  43.64 
 
 		 308 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27605 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  44.25 
 
 		 308 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3380  urea ABC transporter, permease protein UrtB  43.55 
 
 		 308 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3571  urea ABC transporter, permease protein UrtB  43.21 
 
 		 308 aa  227  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3689  urea ABC transporter, permease protein UrtB  43.55 
 
 		 308 aa  228  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2249  putative urea ABC transporter  38.79 
 
 		 384 aa  227  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2974  putative branched-chain amino acid transport system permease protein  42.51 
 
 		 307 aa  226  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1774  inner-membrane translocator  43.51 
 
 		 305 aa  226  7e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.682783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3863  inner-membrane translocator  42.96 
 
 		 308 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.343461  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>