More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1309 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1309  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 277 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5901  inner-membrane translocator  85.2 
 
 		 277 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2992  hypothetical protein  62.45 
 
 		 278 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4423  inner-membrane translocator  59.06 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5696  inner-membrane translocator  60.51 
 
 		 277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0633933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6649  inner-membrane translocator  60.51 
 
 		 277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.0600103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0053  inner-membrane translocator  59.85 
 
 		 278 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4265  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271034  decreased coverage  0.00000610723 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.36 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0146  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000678204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4451  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.2 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0795745 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3820  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4291  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956454 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  34.8 
 
 		 543 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.71 
 
 		 537 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.39 
 
 		 545 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.95 
 
 		 520 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32 
 
 		 558 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 542 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  31.2 
 
 		 542 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 537 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0350  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1505  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  29.82 
 
 		 542 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1288  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4150  inner-membrane translocator  33.08 
 
 		 545 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 554 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.83 
 
 		 550 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 548 aa  136  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0994  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 642 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  31.2 
 
 		 537 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.2 
 
 		 545 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.02 
 
 		 296 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.66 
 
 		 523 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3019  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 547 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.94 
 
 		 539 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 524 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2664  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0300  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  35.27 
 
 		 642 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247535  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  30.55 
 
 		 524 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1944  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 642 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2745  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.08 
 
 		 525 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0589  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 500 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.892329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 551 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0700  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 522 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0993  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 592 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4842  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  32.87 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25148  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3799  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 300 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4077  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.75 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4899  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.87 
 
 		 495 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5758  inner-membrane translocator  33.18 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.663374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 526 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4634  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.87 
 
 		 495 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23273  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.46 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4427  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 529 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483913  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.85 
 
 		 551 aa  125  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3203  branched chain amino acid ABC transporter permease  37.73 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4720  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 484 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149683  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 540 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  35.04 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4018  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 639 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4886  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 		 529 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 527 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 308 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.57 
 
 		 539 aa  122  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3113  urea ABC transporter, permease protein UrtB  28.72 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1954  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.82 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.55 
 
 		 528 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 652 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 526 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64280  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.57 
 
 		 529 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00501395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1989  inner-membrane translocator  29.06 
 
 		 524 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.517253  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  29.02 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 534 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  27.08 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2564  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 		 540 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  29.06 
 
 		 515 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2049  putative amino acid ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 		 538 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3866  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3321  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3104  putative amino acid ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 		 542 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3128  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 		 542 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3571  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.74 
 
 		 308 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0227  Fis family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 537 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.903114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3689  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.74 
 
 		 308 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00882  Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  31.23 
 
 		 538 aa  115  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>