More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1288 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1288  inner-membrane translocator  100 
 
 		 294 aa  570  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1505  inner-membrane translocator  97.96 
 
 		 294 aa  545  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  45.45 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  46.43 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  43.1 
 
 		 534 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1954  branched chain amino acid ABC transporter permease  43.93 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  45.52 
 
 		 551 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  43.84 
 
 		 526 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3380  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.21 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3863  inner-membrane translocator  43.34 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.343461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4018  inner-membrane translocator  44.37 
 
 		 639 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  43.84 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  43.84 
 
 		 524 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3689  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.21 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.76 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  43.15 
 
 		 527 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3571  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.87 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  43.82 
 
 		 543 aa  209  6e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1253  inner-membrane translocator  41.98 
 
 		 308 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1673  urea ABC transporter, permease protein UrtB  48.61 
 
 		 292 aa  208  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5511  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.95 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  42.32 
 
 		 542 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.02 
 
 		 545 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.21 
 
 		 545 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0594  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.87 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.86 
 
 		 558 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.96 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.16 
 
 		 551 aa  206  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  42.61 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0977  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.56 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  43.68 
 
 		 550 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  44.52 
 
 		 528 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  43.32 
 
 		 537 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.37 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  43.17 
 
 		 542 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  43.32 
 
 		 554 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 542 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4150  inner-membrane translocator  43.93 
 
 		 545 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 547 aa  202  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.88 
 
 		 537 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  40.41 
 
 		 548 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.16 
 
 		 523 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4077  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.72 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0655  branched chain amino acid ABC transporter permease  42.56 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1774  inner-membrane translocator  41.1 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.682783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  41.16 
 
 		 537 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3113  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.79 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  41.52 
 
 		 520 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  41.11 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00882  Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  42.7 
 
 		 538 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0994  inner-membrane translocator  42.21 
 
 		 642 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2974  putative branched-chain amino acid transport system permease protein  39.1 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3866  inner-membrane translocator  41.91 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.47 
 
 		 515 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  41.13 
 
 		 301 aa  195  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.14 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0300  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  42.29 
 
 		 642 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247535  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1944  inner-membrane translocator  41.94 
 
 		 642 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0698  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  44.64 
 
 		 534 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0832776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  43.68 
 
 		 526 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1989  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 524 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.517253  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3588  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.45 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  44.24 
 
 		 539 aa  188  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1422  inner-membrane translocator  43.38 
 
 		 526 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4886  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.71 
 
 		 529 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  40.88 
 
 		 540 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2745  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.39 
 
 		 525 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64280  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.39 
 
 		 529 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00501395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0700  inner-membrane translocator  44.12 
 
 		 522 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1201  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 527 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1339  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  44.12 
 
 		 533 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.388899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0189  inner-membrane translocator  44.97 
 
 		 567 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2872  urea ABC transporter, permease protein UrtB  44.49 
 
 		 533 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0183692  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4427  inner-membrane translocator  42.36 
 
 		 529 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483913  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2793  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  44.12 
 
 		 515 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0589  inner-membrane translocator  43.06 
 
 		 500 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.892329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0221  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.83 
 
 		 304 aa  182  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3144  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.83 
 
 		 304 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.721908  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.86 
 
 		 539 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4265  inner-membrane translocator  39.05 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271034  decreased coverage  0.00000610723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0565  inner-membrane translocator  40.69 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2483  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.6 
 
 		 540 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5669  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.48 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4291  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956454 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3733  inner-membrane translocator  40.48 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4635  inner-membrane translocator  40.48 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0953  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.03 
 
 		 549 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0953  inner-membrane translocator  40.44 
 
 		 545 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.794484  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1102  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.67 
 
 		 561 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4842  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  42.65 
 
 		 346 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25148  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0731  putative amino acid ABC transporter, permease protein  40.79 
 
 		 538 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4899  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.65 
 
 		 495 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4720  inner-membrane translocator  42.65 
 
 		 484 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149683  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2177  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  40.79 
 
 		 540 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3104  putative amino acid ABC transporter, permease protein  40.79 
 
 		 542 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3128  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.79 
 
 		 542 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3068  putative amino acid ABC transporter, permease protein  40.79 
 
 		 542 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2564  putative amino acid ABC transporter, permease protein  40.79 
 
 		 540 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10716  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2049  putative amino acid ABC transporter, permease protein  40.79 
 
 		 538 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>