More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3104 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2177  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  99.63 
 
 
540 aa  1044    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281547  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0797  urea ABC transporter, permease protein UrtB  86.85 
 
 
539 aa  803    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2049  putative amino acid ABC transporter, permease protein  99.63 
 
 
538 aa  1040    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3128  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  99.82 
 
 
542 aa  1052    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4013  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  86.85 
 
 
539 aa  841    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1503  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  95.2 
 
 
542 aa  909    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0128621  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3068  putative amino acid ABC transporter, permease protein  99.63 
 
 
542 aa  1050    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3104  putative amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 
542 aa  1052    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0879  urea ABC transporter, permease protein UrtB  87.03 
 
 
539 aa  821    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0731  putative amino acid ABC transporter, permease protein  99.44 
 
 
538 aa  1039    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3684  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  80.89 
 
 
552 aa  798    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2252  urea ABC transporter, permease protein UrtB  79.21 
 
 
543 aa  775    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842238  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2483  urea ABC transporter, permease protein UrtB  86.63 
 
 
540 aa  800    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0953  urea ABC transporter, permease protein UrtB  80.31 
 
 
549 aa  791    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0430  inner-membrane translocator  87.03 
 
 
539 aa  818    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0786  inner-membrane translocator  86.65 
 
 
539 aa  801    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2564  putative amino acid ABC transporter, permease protein  99.81 
 
 
540 aa  1045    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10716  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0909  inner-membrane translocator  87.03 
 
 
539 aa  818    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1869  urea ABC transporter, permease protein UrtB  62.48 
 
 
543 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180379  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2192  urea ABC transporter, permease protein UrtB  62.38 
 
 
543 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788858  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2040  ABC transporter permease  64.91 
 
 
538 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.552564  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0987  inner-membrane translocator  62.79 
 
 
553 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573252  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0953  inner-membrane translocator  61.49 
 
 
545 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.794484  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1201  inner-membrane translocator  57.23 
 
 
527 aa  548  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  54.08 
 
 
524 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  54.62 
 
 
524 aa  512  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  53.96 
 
 
526 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  55.43 
 
 
528 aa  498  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  56.55 
 
 
526 aa  485  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  52.12 
 
 
515 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  54.56 
 
 
527 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0698  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  53.89 
 
 
534 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0832776  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0589  inner-membrane translocator  57.42 
 
 
500 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.892329  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4886  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.91 
 
 
529 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4427  inner-membrane translocator  53.5 
 
 
529 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483913  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  51.52 
 
 
539 aa  433  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3932  urea ABC transporter, permease protein UrtB  54.99 
 
 
543 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4634  urea ABC transporter, permease protein UrtB  58.35 
 
 
495 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23273  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4899  urea ABC transporter, permease protein UrtB  57.55 
 
 
495 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4720  inner-membrane translocator  56.89 
 
 
484 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149683  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  50.91 
 
 
539 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2872  urea ABC transporter, permease protein UrtB  49.9 
 
 
533 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0183692  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1339  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  49.9 
 
 
533 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.388899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2793  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  49.9 
 
 
515 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1422  inner-membrane translocator  51.98 
 
 
526 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2745  urea ABC transporter, permease protein UrtB  50.31 
 
 
525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64280  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.79 
 
 
529 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00501395  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1437  inner-membrane translocator  52.82 
 
 
525 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0700  inner-membrane translocator  52.5 
 
 
522 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214465  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  44.17 
 
 
548 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1989  inner-membrane translocator  49.32 
 
 
524 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.517253  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  45.86 
 
 
537 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  48.24 
 
 
537 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  48.08 
 
 
520 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  46.72 
 
 
558 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5580  branched-chain amino acid ABC transporter permease  52.96 
 
 
529 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4842  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  67.29 
 
 
346 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25148  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  47.18 
 
 
542 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  46.76 
 
 
542 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  47.77 
 
 
523 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  46.8 
 
 
550 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0189  inner-membrane translocator  48.15 
 
 
567 aa  372  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  44.59 
 
 
545 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  43.76 
 
 
542 aa  362  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4150  inner-membrane translocator  48.16 
 
 
545 aa  360  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  46.79 
 
 
554 aa  360  4e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  48.92 
 
 
545 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  43.64 
 
 
537 aa  351  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0993  inner-membrane translocator  44.57 
 
 
592 aa  351  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  42.5 
 
 
540 aa  349  9e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  46.34 
 
 
551 aa  346  6e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  43.07 
 
 
534 aa  341  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  39.56 
 
 
547 aa  340  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0227  Fis family transcriptional regulator  40.12 
 
 
537 aa  340  5e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.903114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  39.28 
 
 
543 aa  331  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00882  Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  41.53 
 
 
538 aa  325  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  53.24 
 
 
297 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  44.56 
 
 
551 aa  309  8e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1102  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.74 
 
 
561 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  53.08 
 
 
292 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  51.2 
 
 
302 aa  268  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1253  inner-membrane translocator  46.08 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  46.41 
 
 
308 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.83 
 
 
293 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5511  urea ABC transporter, permease protein UrtB  46.08 
 
 
308 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  44.14 
 
 
300 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4077  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.67 
 
 
293 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3863  inner-membrane translocator  45.75 
 
 
308 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.343461  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2974  putative branched-chain amino acid transport system permease protein  46.9 
 
 
307 aa  250  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3866  inner-membrane translocator  47.4 
 
 
308 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3571  urea ABC transporter, permease protein UrtB  46.21 
 
 
308 aa  248  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  48.62 
 
 
296 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3689  urea ABC transporter, permease protein UrtB  46.55 
 
 
308 aa  247  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3380  urea ABC transporter, permease protein UrtB  46.55 
 
 
308 aa  247  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0994  inner-membrane translocator  44.88 
 
 
642 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0655  branched chain amino acid ABC transporter permease  44.44 
 
 
308 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4018  inner-membrane translocator  48.46 
 
 
639 aa  243  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  44.64 
 
 
308 aa  241  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0977  urea ABC transporter, permease protein UrtB  43.14 
 
 
308 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0300  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  45.09 
 
 
642 aa  240  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>