More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5696 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5696  inner-membrane translocator  100 
 
 		 277 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0633933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6649  inner-membrane translocator  96.39 
 
 		 277 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.0600103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4423  inner-membrane translocator  73.29 
 
 		 277 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2992  hypothetical protein  65.83 
 
 		 278 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5901  inner-membrane translocator  60.14 
 
 		 277 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134465 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1309  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  60.51 
 
 		 277 aa  332  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0053  inner-membrane translocator  59.78 
 
 		 278 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.07 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0146  inner-membrane translocator  39.21 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000678204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4265  inner-membrane translocator  36.2 
 
 		 291 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271034  decreased coverage  0.00000610723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3820  inner-membrane translocator  37.77 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.5 
 
 		 551 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 652 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.36 
 
 		 558 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.29 
 
 		 545 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.29 
 
 		 523 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  33.57 
 
 		 542 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 524 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 524 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1505  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0994  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 642 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 537 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4291  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956454 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.82 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  34.91 
 
 		 543 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1954  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.97 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4451  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.14 
 
 		 288 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0795745 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  33.71 
 
 		 540 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 542 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.95 
 
 		 537 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1288  inner-membrane translocator  33.83 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.32 
 
 		 520 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 537 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 542 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 		 290 aa  128  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0350  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 547 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.06 
 
 		 545 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4150  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 545 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  37.64 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 534 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.69 
 
 		 550 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1989  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 524 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.517253  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.17 
 
 		 296 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0300  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  35.95 
 
 		 642 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247535  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 526 aa  125  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1944  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 642 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 527 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  34.16 
 
 		 548 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.75 
 
 		 528 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00882  Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  34.56 
 
 		 538 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 526 aa  122  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.32 
 
 		 539 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2745  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.32 
 
 		 525 aa  122  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0700  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 522 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4842  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.47 
 
 		 346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25148  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4634  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.85 
 
 		 495 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23273  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0589  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.892329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  37.64 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1201  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 527 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  37.64 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  37.45 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 554 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5758  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.663374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1774  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.682783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4899  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.47 
 
 		 495 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4077  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.63 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4886  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.98 
 
 		 529 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4720  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 484 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149683  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.94 
 
 		 515 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1422  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 526 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.71 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3799  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4427  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 529 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483913  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  32.49 
 
 		 286 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.45 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.26 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6070  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4018  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 639 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 551 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0993  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 592 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.7 
 
 		 539 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>