More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5901 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5901  inner-membrane translocator  100 
 
 		 277 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134465 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1309  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  85.2 
 
 		 277 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2992  hypothetical protein  60.44 
 
 		 278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4423  inner-membrane translocator  59.42 
 
 		 277 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0053  inner-membrane translocator  61.59 
 
 		 278 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5696  inner-membrane translocator  60.14 
 
 		 277 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0633933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6649  inner-membrane translocator  59.78 
 
 		 277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.0600103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0146  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000678204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.87 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4265  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271034  decreased coverage  0.00000610723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.64 
 
 		 545 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.87 
 
 		 558 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3820  inner-membrane translocator  35 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4291  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4451  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.23 
 
 		 288 aa  148  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0795745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 548 aa  146  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  32.36 
 
 		 542 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 524 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.33 
 
 		 523 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 537 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1505  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1288  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 524 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4150  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 545 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  33.71 
 
 		 554 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5758  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 289 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.663374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.58 
 
 		 537 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 526 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 537 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 526 aa  135  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0994  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 642 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  32.97 
 
 		 543 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 534 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 527 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0350  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.84 
 
 		 520 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 287 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 542 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 287 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.05 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  35.9 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.02 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 542 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.46 
 
 		 545 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.46 
 
 		 550 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 547 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.94 
 
 		 539 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3866  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4077  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.48 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.64 
 
 		 528 aa  129  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4842  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 		 346 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25148  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.16 
 
 		 551 aa  128  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4899  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.33 
 
 		 495 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0700  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 522 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0993  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 592 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4634  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.33 
 
 		 495 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23273  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2745  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.71 
 
 		 525 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1944  inner-membrane translocator  33.48 
 
 		 642 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4720  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 484 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149683  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0300  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  33.48 
 
 		 642 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247535  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.55 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0589  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 500 aa  125  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.892329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2664  inner-membrane translocator  40.64 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3144  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.85 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.721908  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3689  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.55 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3571  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.55 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1989  inner-membrane translocator  31.46 
 
 		 524 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.517253  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3380  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.55 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0879  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.2 
 
 		 539 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4427  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 529 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483913  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0430  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 539 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0909  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 539 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64280  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.34 
 
 		 529 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00501395  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.82 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3019  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 540 aa  122  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0594  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.33 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0797  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.82 
 
 		 539 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1422  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 526 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2483  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.82 
 
 		 540 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3321  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.09 
 
 		 539 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 551 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0786  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 539 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4886  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 		 529 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1774  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.682783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 652 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3113  urea ABC transporter, permease protein UrtB  28.57 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5669  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.93 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3733  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4635  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4013  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.44 
 
 		 539 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0977  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.43 
 
 		 308 aa  118  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>