More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3321 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3321  inner-membrane translocator  100 
 
 		 290 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3203  branched chain amino acid ABC transporter permease  76.12 
 
 		 290 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3019  inner-membrane translocator  75.09 
 
 		 290 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2664  inner-membrane translocator  74.39 
 
 		 290 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4291  inner-membrane translocator  60.42 
 
 		 288 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5758  inner-membrane translocator  59.86 
 
 		 289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.663374 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0808  inner-membrane translocator  59.52 
 
 		 289 aa  292  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1561  urea ABC transporter, permease protein UrtB  50.69 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4451  branched chain amino acid ABC transporter permease  44.69 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0795745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0350  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.82 
 
 		 558 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.09 
 
 		 545 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.18 
 
 		 523 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  39.35 
 
 		 537 aa  171  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  38.55 
 
 		 542 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 537 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  40.74 
 
 		 554 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.19 
 
 		 537 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0227  Fis family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 537 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.903114 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 534 aa  165  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.1 
 
 		 545 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.1 
 
 		 550 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 542 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 542 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  38.46 
 
 		 520 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  39.21 
 
 		 548 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1505  inner-membrane translocator  38.58 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 524 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1288  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 524 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 527 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4150  inner-membrane translocator  39.71 
 
 		 545 aa  158  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  39.34 
 
 		 551 aa  158  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4265  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271034  decreased coverage  0.00000610723 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0146  inner-membrane translocator  40.59 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000678204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  38.69 
 
 		 526 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2745  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.2 
 
 		 525 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 526 aa  152  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  38.85 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.35 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3380  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.97 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.15 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.41 
 
 		 528 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1954  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.3 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5901  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1253  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.63 
 
 		 292 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1309  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.69 
 
 		 277 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.21 
 
 		 308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3571  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.27 
 
 		 308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2992  hypothetical protein  36.16 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3932  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.48 
 
 		 543 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  37.78 
 
 		 540 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0698  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  38.85 
 
 		 534 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0832776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3863  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.343461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3689  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.27 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.3 
 
 		 515 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 547 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1774  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.682783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3820  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 295 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0655  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.22 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.09 
 
 		 539 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4077  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0953  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 545 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.794484  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  33.7 
 
 		 543 aa  142  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5511  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.36 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0987  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 553 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0594  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.89 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00882  Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  35.82 
 
 		 538 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1989  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 524 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.517253  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0977  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.8 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.56 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2974  putative branched-chain amino acid transport system permease protein  33.45 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.05 
 
 		 551 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.04 
 
 		 539 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3113  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.56 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  37.73 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.21 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0221  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.15 
 
 		 304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0786  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 539 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1503  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.04 
 
 		 542 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0128621  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1256  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.68 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0765921 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3866  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4423  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1102  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.06 
 
 		 561 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1869  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.56 
 
 		 543 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180379  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2192  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.81 
 
 		 543 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788858  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2483  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.83 
 
 		 540 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3144  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.1 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.721908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0797  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.06 
 
 		 539 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1422  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 526 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.49 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1710  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.51 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4634  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.59 
 
 		 495 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23273  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4842  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  38.59 
 
 		 346 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25148  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4720  inner-membrane translocator  38.59 
 
 		 484 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149683  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4899  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.59 
 
 		 495 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64280  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 		 529 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00501395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>