More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1256 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1256  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 285 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0765921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0941  inner-membrane translocator  63.57 
 
 		 285 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1044  inner-membrane translocator  63.57 
 
 		 285 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.61 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4265  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271034  decreased coverage  0.00000610723 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0146  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000678204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4291  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0350  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3820  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 524 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5758  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.663374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  35.34 
 
 		 542 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 524 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 548 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1201  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 527 aa  142  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.51 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0953  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 545 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.794484  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 537 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 526 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2192  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.72 
 
 		 543 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788858  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 542 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 537 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4451  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.21 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0795745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.82 
 
 		 520 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.82 
 
 		 537 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.76 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1869  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.34 
 
 		 543 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180379  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0953  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.21 
 
 		 549 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.92 
 
 		 551 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 534 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 542 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0879  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.58 
 
 		 539 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0430  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 539 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0909  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 539 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6070  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0786  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 539 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0797  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.21 
 
 		 539 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4013  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.21 
 
 		 539 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3684  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.45 
 
 		 552 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2040  ABC transporter permease  33.21 
 
 		 538 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.552564  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5901  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2483  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.45 
 
 		 540 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  29.93 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1503  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 		 542 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0128621  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 554 aa  132  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.33 
 
 		 528 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2049  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 		 538 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3128  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 		 542 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2564  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 		 540 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3068  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 		 542 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3104  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 		 542 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  32.29 
 
 		 543 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2252  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.08 
 
 		 543 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0731  putative amino acid ABC transporter, permease protein  32.45 
 
 		 538 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 540 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2177  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  32.45 
 
 		 540 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 527 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.53 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1989  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 524 aa  129  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.517253  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.58 
 
 		 539 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.22 
 
 		 523 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4150  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 545 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.57 
 
 		 558 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 551 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1288  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 294 aa  125  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.87 
 
 		 545 aa  125  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.97 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1673  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.98 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.35 
 
 		 545 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1505  inner-membrane translocator  31.77 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1309  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.96 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0700  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 522 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3203  branched chain amino acid ABC transporter permease  37.55 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 547 aa  122  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1954  branched chain amino acid ABC transporter permease  29.64 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3674  putative urea/short-chain amide transport system permease protein  32.07 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0701  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.08 
 
 		 294 aa  122  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.879979  hitchhiker  0.000000462234 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2745  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.21 
 
 		 525 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.99 
 
 		 550 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 526 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4886  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 529 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4427  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 529 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483913  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0987  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 553 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3932  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.7 
 
 		 543 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>