More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6070 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6070  inner-membrane translocator  100 
 
 		 286 aa  555  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.54 
 
 		 291 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.59 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4265  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271034  decreased coverage  0.00000610723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0146  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000678204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3820  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1675  inner-membrane translocator  39.43 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3758  putative ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 		 287 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2519  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2331  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 291 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 551 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3165  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 534 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  34.84 
 
 		 542 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.52 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0225  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  32.03 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.52 
 
 		 295 aa  138  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4400  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 304 aa  138  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 305 aa  138  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.74 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1579  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 315 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.687848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.8 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  30.64 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2952  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  30.3 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.03 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.84 
 
 		 523 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2031  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2949  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3168  inner-membrane translocator  33.6 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  32.03 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 537 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  34.4 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 330 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4108  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 547 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0837  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997014  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  35.23 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  32.03 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  30.71 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.71 
 
 		 558 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3725  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0553822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 524 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.96 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4026  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3594  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.577522 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  33.7 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4168  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3294  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  34.17 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0420921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 542 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4104  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 524 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.33 
 
 		 545 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  30.96 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.03 
 
 		 545 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.41 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 527 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.42 
 
 		 520 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>