More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1804 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1804  inner-membrane translocator  100 
 
 		 323 aa  622  1e-177  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.68636 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0317  inner-membrane translocator  75.54 
 
 		 323 aa  492  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1504  inner-membrane translocator  48.41 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.163157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0826  inner-membrane translocator  51.6 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0591  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000340346 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0600  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0445  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1761  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328925  hitchhiker  0.000752559 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1582  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 289 aa  112  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2158  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 336 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 288 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 288 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1275  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.732042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1518  hypothetical protein  30.94 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.442526 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  29.32 
 
 		 296 aa  99.4  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1740  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 370 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3929  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0507  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 291 aa  96.3  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1979  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  26.77 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.78 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  30.49 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 287 aa  92.4  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  27.91 
 
 		 481 aa  90.5  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2888  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 446 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  29.66 
 
 		 652 aa  89.4  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3008  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3086  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 370 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.87 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 319 aa  86.3  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1972  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 462 aa  86.3  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3010  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000508141  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 603 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.03 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4423  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2926  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.4 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  27.39 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1158  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 446 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546012  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1505  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.45 
 
 		 603 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  29.92 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 603 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.03 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.03 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  30 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 603 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 603 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  27.8 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  29.48 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1571  inner-membrane translocator  28.7 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.350199  normal  0.598455 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1940  inner-membrane translocator  27.42 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.18 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  27.51 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2098  inner-membrane translocator  44.86 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0236105 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  26.9 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  29.76 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0483  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0847  inner-membrane translocator  28.78 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1547  inner-membrane translocator  29.74 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1288  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  27.95 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  27.63 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1428  inner-membrane translocator  30.93 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.399664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.57 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  30.59 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  29.92 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1231  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126142 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0108  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 493 aa  76.6  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  28.89 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  28.23 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  29.21 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  26.25 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  28.35 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0923  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161069  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  26.92 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1577  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  29.7 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.46 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  28.18 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4090  branched chain amino acid ABC transporter permease  28.16 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00306357  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  30 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3013  inner-membrane translocator  30.11 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.265613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>