More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2888 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2888  inner-membrane translocator  100 
 
 		 446 aa  868    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  57.6 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1158  inner-membrane translocator  48.85 
 
 		 446 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1231  inner-membrane translocator  46.19 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  42.76 
 
 		 481 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3013  inner-membrane translocator  36.85 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.265613  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0108  inner-membrane translocator  45.45 
 
 		 493 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2203  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 492 aa  212  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3158  inner-membrane translocator  37.39 
 
 		 518 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1972  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 462 aa  202  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  40 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 382 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  37.37 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 287 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 289 aa  165  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  40.41 
 
 		 290 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 288 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 288 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4898  inner-membrane translocator  38.84 
 
 		 342 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1740  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 370 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3086  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2098  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0236105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3008  inner-membrane translocator  38.25 
 
 		 288 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 289 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 302 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 302 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 		 291 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 		 289 aa  124  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0507  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 302 aa  123  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  27.72 
 
 		 300 aa  122  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.16 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 		 291 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 309 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.7 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  30.7 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.38 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.7 
 
 		 316 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.38 
 
 		 294 aa  116  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  28.27 
 
 		 291 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  29.22 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.38 
 
 		 316 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.37 
 
 		 289 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.01 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.88 
 
 		 298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 309 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 		 298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1979  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  30.16 
 
 		 305 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1838  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  31.53 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  29.66 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.4 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  31.52 
 
 		 293 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 298 aa  113  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.4 
 
 		 294 aa  113  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  29.19 
 
 		 335 aa  113  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0734  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 324 aa  113  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993171  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 290 aa  113  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 		 298 aa  113  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 300 aa  113  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2031  inner-membrane translocator  28.12 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  30.32 
 
 		 301 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  31.46 
 
 		 308 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 316 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.34 
 
 		 316 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 316 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2158  inner-membrane translocator  28.66 
 
 		 336 aa  110  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 291 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  28.47 
 
 		 294 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2016  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 294 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.143  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 603 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 291 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 603 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 293 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 316 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 292 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 317 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.33 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 316 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64890  putative permease of ABC branched chain amino acid transporter  28.08 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.55 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.07 
 
 		 603 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1547  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 287 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  29.22 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3963  inner-membrane translocator  28.96 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>