More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3010 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3010  inner-membrane translocator  100 
 
 		 291 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000508141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  39.25 
 
 		 290 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  39.59 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.84 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  37.29 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1781  ABC transporter permease  34.36 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0603975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4242  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 290 aa  165  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1742  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0350501  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0350  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.018915  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.59 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 294 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4095  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  32.08 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  27.99 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3557  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3164  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  32.51 
 
 		 287 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.73 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23000  branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  33.89 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.135077  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  30.95 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3583  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 603 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 287 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.86 
 
 		 603 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 603 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 603 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.03 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  32.78 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 603 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  32.78 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.78 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.78 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.45 
 
 		 319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3831  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  32.23 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1558  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 319 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 319 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.35 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0829  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_816  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.86 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.648564  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0945  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.53 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.67 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.67 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.67 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.77 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 308 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  30.85 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>