More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1928 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  100 
 
 		 290 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  72.76 
 
 		 290 aa  421  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  62.41 
 
 		 290 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  62.24 
 
 		 290 aa  351  8.999999999999999e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  43.01 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  40.78 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 288 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  40.07 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  42.61 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 		 294 aa  201  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.01 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0005  inner-membrane translocator  40 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901395  hitchhiker  0.00000431174 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  42.03 
 
 		 296 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.19 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  40.35 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0313  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1601  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  35.87 
 
 		 277 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  36.97 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.01 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 288 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0852  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5641  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5536  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898761  hitchhiker  0.00000762258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7434  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  34.39 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1139  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0907  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.794087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0327  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0975712  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.57 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  33.33 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.66 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4887  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4798  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337539  normal  0.0254161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2302  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.418685 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3399  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5975  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 285 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5695  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4442  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0759  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000754526 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2918  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1140  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 307 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125696  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1174  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 307 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0802  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 286 aa  132  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1157  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 307 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197851  normal  0.0247648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4277  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9657  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.54 
 
 		 289 aa  132  9e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.33 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3519  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1543  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 289 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6136  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0756138  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2284  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 311 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>