More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1829 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  100 
 
 		 289 aa  566  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0852  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  84.43 
 
 		 289 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  63.86 
 
 		 288 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  64.21 
 
 		 288 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  63.86 
 
 		 288 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  64.56 
 
 		 288 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  61.97 
 
 		 288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  47.95 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  40 
 
 		 290 aa  221  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  41.05 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0313  inner-membrane translocator  45.55 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  40.43 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  41.73 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  39.64 
 
 		 290 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.71 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 293 aa  185  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.35 
 
 		 294 aa  185  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.89 
 
 		 290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  40.35 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.2 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  38.19 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  37.81 
 
 		 287 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.29 
 
 		 292 aa  178  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0327  inner-membrane translocator  40.48 
 
 		 293 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0975712  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0802  inner-membrane translocator  40.86 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5641  inner-membrane translocator  40.78 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  36.11 
 
 		 325 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  37.68 
 
 		 291 aa  165  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2331  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 300 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.729625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  38.35 
 
 		 285 aa  162  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 290 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0005  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901395  hitchhiker  0.00000431174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 		 301 aa  158  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 		 298 aa  155  9e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  36.03 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2302  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.418685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1601  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5536  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 287 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898761  hitchhiker  0.00000762258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  34.09 
 
 		 308 aa  152  8e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0513  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0503611  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 319 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7434  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  32.18 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4277  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9657  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1140  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 307 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125696  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1157  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 307 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197851  normal  0.0247648 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1174  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 307 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.59 
 
 		 316 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.78 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2284  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0907  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.794087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.47 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  32.27 
 
 		 316 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.27 
 
 		 316 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>