More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0907 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0907  inner-membrane translocator  100 
 
 		 292 aa  560  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.794087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4442  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  38.25 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  39.36 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  39.36 
 
 		 288 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.74 
 
 		 287 aa  176  6e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.74 
 
 		 287 aa  176  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  36.17 
 
 		 290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0313  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.76 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.39 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.46 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  31.47 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2302  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.418685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 295 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5536  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 287 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898761  hitchhiker  0.00000762258 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7434  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  35.56 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  35 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 292 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1543  inner-membrane translocator  33.74 
 
 		 289 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 294 aa  138  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2331  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.729625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  27.85 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  31.93 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5641  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.94 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  28.28 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 291 aa  132  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 294 aa  132  9e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 292 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.22 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 301 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  31.99 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  28.76 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  30.46 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 290 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  29.83 
 
 		 295 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0005  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901395  hitchhiker  0.00000431174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0852  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 652 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4887  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  29.11 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  28.62 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2284  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4798  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337539  normal  0.0254161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0327  inner-membrane translocator  33.91 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0975712  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4423  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240774  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0513  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0503611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  27.55 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 309 aa  116  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  28.07 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2918  inner-membrane translocator  32.51 
 
 		 290 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0734  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993171  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2498  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  30.95 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.72 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.35 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  29.66 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  29.93 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  29.31 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>