More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3619 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  100 
 
 		 305 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  94.86 
 
 		 292 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  93.15 
 
 		 292 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  87.67 
 
 		 292 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  83.75 
 
 		 277 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  70.89 
 
 		 292 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  70.89 
 
 		 292 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  69.52 
 
 		 291 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  42.46 
 
 		 288 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  42.11 
 
 		 288 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 290 aa  195  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  39.44 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 290 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3399  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.89 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  40.35 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.92 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  36.11 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0313  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 		 294 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 288 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2302  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.418685 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2331  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.729625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1601  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0852  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.98 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0005  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901395  hitchhiker  0.00000431174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1139  inner-membrane translocator  31.32 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0847  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4442  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0327  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0975712  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1543  inner-membrane translocator  30.13 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4887  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7434  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  28.32 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  30.64 
 
 		 303 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0505  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0978839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5641  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1523  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00164732  normal  0.617596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1973  inner-membrane translocator  33.04 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.38 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  30.23 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 652 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 290 aa  116  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4798  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337539  normal  0.0254161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0116  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0548  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.081498  hitchhiker  0.0000417079 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0513  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0503611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5536  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898761  hitchhiker  0.00000762258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  30.03 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 548 aa  113  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  28.28 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0802  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 286 aa  112  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4018  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 639 aa  112  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 534 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  29.69 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.99 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  29.19 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2284  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0907  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.794087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0447  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.98 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>