More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0550 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  100 
 
 		 293 aa  550  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  89.42 
 
 		 293 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  91.13 
 
 		 293 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  87.71 
 
 		 293 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  88.05 
 
 		 293 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  73.38 
 
 		 293 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  75.09 
 
 		 293 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  73.72 
 
 		 293 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  73.72 
 
 		 293 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  74.4 
 
 		 293 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  74.4 
 
 		 293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  69.97 
 
 		 293 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43770  inner-membrane translocator  75.77 
 
 		 293 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1437  inner-membrane translocator  72.7 
 
 		 297 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522267  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  71.23 
 
 		 296 aa  391  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5147  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  72.16 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2723  inner-membrane translocator  63.49 
 
 		 304 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.956007  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0251  inner-membrane translocator  63.49 
 
 		 304 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.477771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0216  inner-membrane translocator  62.83 
 
 		 304 aa  341  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5008  inner-membrane translocator  58.06 
 
 		 309 aa  326  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0262  inner-membrane translocator  62.17 
 
 		 304 aa  326  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3609  inner-membrane translocator  55.48 
 
 		 309 aa  322  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0785  inner-membrane translocator  57.1 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1157  inner-membrane translocator  56.77 
 
 		 309 aa  308  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0050  inner-membrane translocator  54.91 
 
 		 326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.681115 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0468  inner-membrane translocator  55.81 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  0.15939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0568  putative branched-chain amino acid transport system permease  56.96 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451582  normal  0.0433103 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0459  inner-membrane translocator  55.48 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.575619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3436  inner-membrane translocator  57.93 
 
 		 309 aa  299  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00170509 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0115  inner-membrane translocator  51.55 
 
 		 328 aa  298  9e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2219  inner-membrane translocator  54.35 
 
 		 329 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.515204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3363  inner-membrane translocator  53.07 
 
 		 309 aa  291  9e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0376  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  52.32 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0602  inner-membrane translocator  56.45 
 
 		 309 aa  285  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.650417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3540  inner-membrane translocator  55.81 
 
 		 309 aa  285  9e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.740436  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5037  inner-membrane translocator  57.89 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.941694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0952  inner-membrane translocator  53.29 
 
 		 329 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.778848 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2277  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  53.29 
 
 		 329 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4006  inner-membrane translocator  50.77 
 
 		 328 aa  275  9e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  47.78 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 290 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0945  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.37 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_816  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.648564  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5288  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.653195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0829  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  32.65 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 294 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0544  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  31.97 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 297 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0137  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2307  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1558  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4095  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0402  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3164  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109839  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2425  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  32.09 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.42 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3831  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2444  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  31.77 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  28.43 
 
 		 335 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  28.76 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  28.25 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  26.3 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  26.3 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4242  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3583  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  25.97 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0430  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0151823  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  25.97 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  26.95 
 
 		 338 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>