More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5602 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5602  inner-membrane translocator  100 
 
 
292 aa  557  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  60.14 
 
 
291 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  41.8 
 
 
316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2267  inner-membrane translocator  42.96 
 
 
296 aa  185  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0641115  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  36.77 
 
 
292 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3907  inner-membrane translocator  44.29 
 
 
293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  35.25 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3794  inner-membrane translocator  44.29 
 
 
293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.192822 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0734  inner-membrane translocator  39.18 
 
 
324 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993171  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  38.83 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.08 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  38.7 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.55 
 
 
291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  38.14 
 
 
291 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  35.76 
 
 
301 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  39.4 
 
 
308 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  37.04 
 
 
301 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  36.43 
 
 
293 aa  169  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01986  amino-acid transmembrane lipoprotein ABC transporter  44.98 
 
 
293 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.230121  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  36.45 
 
 
311 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  36.3 
 
 
293 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  38.49 
 
 
308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  38.49 
 
 
319 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  38.49 
 
 
319 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  38.49 
 
 
308 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  38.54 
 
 
308 aa  165  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2270  inner-membrane translocator  39.79 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  38.49 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  37.62 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.62 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.62 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.83 
 
 
319 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0332  inner-membrane translocator  38.75 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  35.81 
 
 
298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.04 
 
 
301 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 
298 aa  162  7e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 
298 aa  162  7e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 
299 aa  162  8.000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  36.66 
 
 
308 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  36.66 
 
 
308 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 
298 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 
293 aa  161  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  36.7 
 
 
301 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  34.02 
 
 
304 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  37.58 
 
 
308 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  34.59 
 
 
300 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  36.18 
 
 
311 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5095  inner-membrane translocator  36.48 
 
 
322 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00123813  normal  0.0753948 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  37.97 
 
 
301 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
316 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  35.37 
 
 
316 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  33.56 
 
 
294 aa  159  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  37.83 
 
 
304 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  37.87 
 
 
308 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  35.1 
 
 
301 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 
289 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  36.52 
 
 
294 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2495  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  37.94 
 
 
313 aa  156  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.799542  hitchhiker  0.00275887 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.69 
 
 
316 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.8 
 
 
298 aa  156  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  33.44 
 
 
317 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  33.78 
 
 
297 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.69 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  32.69 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  33.66 
 
 
309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  38.16 
 
 
308 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.69 
 
 
316 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.36 
 
 
316 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  34.83 
 
 
291 aa  155  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  34.32 
 
 
309 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  34.32 
 
 
338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  33.66 
 
 
308 aa  153  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  32.79 
 
 
316 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  32.47 
 
 
316 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.47 
 
 
316 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  32.79 
 
 
316 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  32.79 
 
 
316 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.14 
 
 
294 aa  152  5e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  37.54 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  37.41 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  34.54 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  34.94 
 
 
303 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  32.47 
 
 
316 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  35.81 
 
 
309 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  32.47 
 
 
316 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  33 
 
 
309 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  34.44 
 
 
302 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  32.47 
 
 
316 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  33 
 
 
309 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  34.11 
 
 
302 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.66 
 
 
316 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  34.68 
 
 
302 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  34.33 
 
 
335 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0046  inner-membrane translocator  37.37 
 
 
290 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
319 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  34.6 
 
 
293 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  38.16 
 
 
289 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  36.75 
 
 
603 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  34.53 
 
 
309 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>