More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1470 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1470  inner-membrane translocator  100 
 
 		 322 aa  620  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5538  inner-membrane translocator  71.74 
 
 		 320 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2957  leucine/isoleucine/valine transport system permease protein  69.57 
 
 		 322 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2858  inner-membrane translocator  65.5 
 
 		 320 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0782878  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3059  inner-membrane translocator  57.1 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00456062  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20610  branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  56.6 
 
 		 348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3773  inner-membrane translocator  51.52 
 
 		 320 aa  278  8e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0402926  hitchhiker  0.00264869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3376  inner-membrane translocator  53.25 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0297907 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3149  inner-membrane translocator  51.85 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.766269  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0342  inner-membrane translocator  53.92 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.85222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  46.2 
 
 		 308 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2956  inner-membrane translocator  51.22 
 
 		 283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.176313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1083  inner-membrane translocator  51.95 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.913177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2038  inner-membrane translocator  53.16 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.865574  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2842  inner-membrane translocator  55.66 
 
 		 336 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  45.17 
 
 		 319 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3573  inner-membrane translocator  56.15 
 
 		 336 aa  238  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.552593  normal  0.0123888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  45.17 
 
 		 308 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  45.79 
 
 		 308 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  46.13 
 
 		 308 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  45.17 
 
 		 319 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  45.17 
 
 		 319 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  44.3 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3019  inner-membrane translocator  56.15 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.410272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3065  inner-membrane translocator  56.15 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3034  inner-membrane translocator  56.15 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal  0.238333 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  43.85 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  44.62 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.85 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.85 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  44.62 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  46.36 
 
 		 302 aa  235  7e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2493  inner-membrane translocator  46.95 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  44.75 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  47.85 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.95 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  44.95 
 
 		 316 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  44.95 
 
 		 316 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  44.95 
 
 		 316 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  42.49 
 
 		 301 aa  232  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  44.95 
 
 		 316 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  44.95 
 
 		 316 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  45.25 
 
 		 308 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  45.03 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.43 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  43.43 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  44.65 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  43.12 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  46.05 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.12 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.12 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  43.13 
 
 		 300 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.9 
 
 		 316 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 311 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  45.11 
 
 		 308 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  44.51 
 
 		 316 aa  228  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  43.13 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.43 
 
 		 316 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  43.45 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  43.63 
 
 		 294 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  42.09 
 
 		 304 aa  225  7e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  42.55 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  40.25 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  41.88 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  44.94 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.77 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.77 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.77 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  42.17 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  45.05 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.16 
 
 		 291 aa  222  6e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  45.82 
 
 		 311 aa  222  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  38.12 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  41.56 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  42.28 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2976  inner-membrane translocator  45.85 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  43.12 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  44.13 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1893  inner-membrane translocator  45.54 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229898  normal  0.0495469 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3144  inner-membrane translocator  43.12 
 
 		 316 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  42.68 
 
 		 309 aa  219  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  42.44 
 
 		 307 aa  219  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  43.08 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2611  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.404951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2031  inner-membrane translocator  43.04 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5685  inner-membrane translocator  51.91 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5396  inner-membrane translocator  47.57 
 
 		 304 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.378795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  41.28 
 
 		 309 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 309 aa  215  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 301 aa  215  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  42.37 
 
 		 335 aa  215  9e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  41.56 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  41.51 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  41.19 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  42.57 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>