More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0586 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0586  inner-membrane translocator  100 
 
 		 307 aa  595  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2031  inner-membrane translocator  54.87 
 
 		 321 aa  296  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  45.6 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  44.01 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  45.07 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  42.35 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  42.72 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  42.54 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  44.63 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  44.3 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.81 
 
 		 301 aa  235  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  44.95 
 
 		 300 aa  235  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.77 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  42.39 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  44.62 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  43.97 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.72 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  44.79 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.77 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.72 
 
 		 316 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  42.72 
 
 		 316 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  42.48 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  42.48 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 		 316 aa  231  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  42.81 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.77 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  43.49 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  42.81 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.41 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  42.53 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  45.28 
 
 		 293 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  43.53 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 290 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 316 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  43.04 
 
 		 338 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 316 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 316 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  42.39 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44 
 
 		 316 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  42.53 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.16 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  42.53 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  41.42 
 
 		 302 aa  229  6e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  42.39 
 
 		 319 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  42.39 
 
 		 319 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  43.59 
 
 		 301 aa  228  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.76 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  43.14 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  40.66 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  42.28 
 
 		 317 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2611  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 304 aa  225  9e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.404951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2976  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 393 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  41.59 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  43.32 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1893  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229898  normal  0.0495469 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  46.75 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  42.26 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.88 
 
 		 291 aa  222  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3005  inner-membrane translocator  50 
 
 		 337 aa  222  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  42.95 
 
 		 294 aa  222  6e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.42 
 
 		 289 aa  221  8e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  42.59 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  43.19 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  42.59 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0759  inner-membrane translocator  43.71 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000754526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  41.8 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  41.56 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  41.99 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  41.94 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  42.59 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3900  inner-membrane translocator  41.83 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  42.86 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3144  inner-membrane translocator  44.31 
 
 		 316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5437  inner-membrane translocator  44.09 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.349252 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  43.97 
 
 		 302 aa  218  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2472  inner-membrane translocator  44.65 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1747  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1751  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48853  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2318  inner-membrane translocator  41.59 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  hitchhiker  0.00247249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2249  inner-membrane translocator  43.79 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.749308 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  41.9 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2081  inner-membrane translocator  41.29 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  41.04 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>